基质辅助激光电离质谱仪的主要配置：
（1）样品盘采用工业标准的微滴定盘设计，可点384个样品，能够放1536个样品；
（2）样品靶可提供具有靶上增敏除盐功能的技术，使灵敏度比普通样品盘提高10-100倍；
（3）可选配多种形式的样品靶板，扩展应用范围。靶板将传统的技术与现代MALDI技术联用，尤其适合测定磷脂类样品；
（4）离子源电离处为高灵敏度的无网格设计；
（5）采用非垂直激发样品，轴向地将离子引出，使离子以简单直接的路径到达检测器，提高离子传输效率，从而提高检测灵敏度；
（6）配备智能化红外激光自动清洗离子源装置，通过软件一键式完成离子源清洗，整个过程在15分钟内完成，确保仪器长期稳定运行。
基质辅助激光电离质谱仪的装置特征：
在宽分子量范围内，保证高质量分辨率和高质量准确度
在合成高分子、蛋白质消化酶的分析中，具有不同分子量分布的样品较多，因而需要能够在宽分子量范围内进行高质量分辨率、高质量准确度的分析。采用SpiralTOF模式离子光学系统，有着其它装置不能比的性能。
线性模式TOF
适合于测试高分子量离子和解析容易产生自身碎裂的样品。
串联模式TOF/TOF
通过高能碰撞诱导解离可以进行MS/MS测试。由于具有高度的先驱离子选择能力，可以从子离子谱图中只选择和观察单一同位素离子。非常适合于复杂的子离子谱图的解析。
