薄层色谱兼备了柱色谱和纸色谱的优点，一方面适用于少量样品(几到几微克，甚至0.01微克)的分离；另一方面在制作薄层板时，把吸附层加厚加大，将样品点成一条线，则可分离多达500mg的样品。因此，又可用来精制样品，此法特别适用于挥发性较小或较高温度易发生变化而不能用气相色谱分析的物质。此外，在进行化学反应时，薄层色谱法还可用来跟踪有机反应及进行柱色谱之前的一种“预试”，常利用薄层色谱观察原料斑点的逐步消失来判断反应是否完成。
在使用薄层色谱做试验时，如果出以下问题会是哪些原因导致的。
①样品及对照品、对照药材均不出点：
原因分析：
(1)薄层板选择错误
(2)展开剂配制错误
(3)显色剂失效或使用错误
(4)逐项排查以上几点无问题仍未有斑点点出，可能原因为点样量不足，应同时加大点样量进行再次检测。
②样品不出点，对照品、对照药材有斑点检出：
原因分析：
(1)样品处理过程发生错误
(2)样品浓度较小导致按正常点样量无法检测应加大点样量进行再次检测。
③样品出点，对照品、对照药材不出点：
原因分析：
(1)对照品、对照药材失效；需重新配制。
④样品出点、对照药材斑点未*分离：
原因分析：
(1)展开距离不够；可以*展开。
(2)展开剂本身配比问题，可以增大极性较大试剂比例。
⑤样品出点，对照品、对照药材斑点显色不清晰：
原因分析：
(1)显色剂用量不够。
(2)加热温度不够或时间不够。
⑥边缘效应：
在平面色谱法中,在同一块色谱板基线上不同位置点上同一种物质,而产生边缘比移值大于中间比移值的现象.
出现这种现象是因为边缘的溶剂蒸发比中间的快,从而加速了边缘的溶剂迁移,让边缘比移值变大.
避免措施：
(1)展开剂预饱和可以减少边缘效应的产生；
(2)远离热源。
