短程分子蒸馏是一种特殊的液-液分离技术，它不同于传统蒸馏依靠沸点差分离原理，而是依靠不同物质分子运动平均自由程的差异来实现分离。
当液体混合物沿着加热板流动并加热时，轻重分子会从液体表面逸出，进入气相。由于轻重分子的自由程度不同，不同物质的分子在从液体表面逸出后有不同的移动距离。如果能适当设置冷凝板，轻分子达到冷凝板的冷凝排出，而重分子达不到冷凝板沿混合液的排出。这样，物质分离的目的就达到了。
短程分子器蒸馏设备中沸腾膜与冷凝面之间的压差是蒸汽流向的驱动力，如果压力减小，蒸汽就会流动。在1mbar下运行，需要在沸腾面和冷凝面之间有非常短的距离。基于这一原理制造的蒸馏器称为短程蒸馏器。短程蒸馏器(分子蒸馏)在加热面对面有内置冷凝器，使操作压力降至0.001mbar。
短程蒸馏器是一种在1~0.001mbar压力下工作的热分离技术过程。它的沸腾温度低，非常适合热敏性和高沸点物料。其基本组成:带加热夹套的圆柱形筒体、转子和内置冷凝器；刮膜器和防飞溅装置精确安装在转子的固定架上。内置冷凝器位于蒸发器的中心，转子在圆柱形筒体和冷凝器之间旋转。
短距离蒸馏器由外加热的垂直圆筒、位于其中心的冷凝器和在蒸馏器和冷凝器之间旋转的刮膜器组成。
蒸馏过程是:将物料从蒸发器顶部加入，通过转子上的液体分布器连续均匀地分布在加热面上，然后刮膜器将液体刮成极薄、湍流的液体膜，螺旋向下推。在这个过程中，从加热面逸出的轻分子通过短路线和几乎没有碰撞的情况下，在内置冷凝器上冷凝成液体，沿着冷凝器管流下，通过蒸发器底部的出料管排出；残液是指重分子在加热区下的圆形通道中收集，然后通过侧出料管流出。至此轻重分子物料分离开，多级串联可优化分离度和增加纯度。
