体视荧光显微镜是显微镜的一种，是各种各样细胞生物学、神经系统学及其他领域研究中进行定性和定量研究的可靠工具之一。目前，体视荧光显微镜是活体动物体内荧光成像技术的核心技术，被用于研究细胞内物质的吸收、运输、化学物质的分布及定位等。
与传统光学显微镜相比，体视荧光显微镜具有体积小、重量轻、操作简单等特点，目前已经广泛应用于医学研究以及生物学研究领域中：
1、 细胞学分析：
通过观察不同细胞的形态结构差异，了解它们之间的亲缘关系和功能特性等。
2、 基因表达分析：
通过观察特定dna分子的变化来检测其是否发生了突变或重组。
3、 生物化学分析：
通过观察特定蛋白质的分布状态来分析其在体内的含量及其活性情况等。
4、 药物筛选和分析：
利用对某种药物的分析结果来判断其对某种疾病的疗效如何；或者通过对某类疾病患者的尿液进行检测来确定该患者所患疾病的类型等。
5、 组织病理学诊断和研究：
利用组织标本上的病理切片进行分析研究，判断出病变组织的性质和来源；也可以根据某些病理特征来进行肿瘤的分期诊断和研究等等。
