微量金属元素：某些微量金属在人体营养中起着很重要的作用，而另一些金属则是强毒性的。因此，在食品生产的几乎每一步骤都要进行监测。元素含量还可以提供食品地理来源和真假的信息。碰撞/反应池(CRC)技术消除了很多多原子干扰，拓宽了ICPMS可以监测的元素范围。此外，采用惰性氦气反应池气体和安捷伦的八极杆反应池系统(ORS)可以筛选多种元素，比如ArC、OCl、ArCl和ArAr，这可能影响微量元素，如Cr、V、As和Se的测量。
真菌毒素真菌毒素是真菌产生的强毒性化合物。当储存条件有利于真菌生长时，真菌毒素就会污染食品。由于已知的真菌毒素有100种化合物，所以难以进行单一真菌毒素的分析；任何单一的毒素在复杂的有机介质中很可能以极低的浓度存在。安捷伦RRLC的快速和高分离能力，常常与质谱结合起来，已经被证明是检测和定量分析这些严格限制的污染物的快速而可靠的方法。
兽药由病毒、细菌、原生动物和真菌引起的动物疾病要用如抗生素这样的药物来预防和治疗。家禽家畜和农田养鱼也可能食用生长刺激药物。由于这些兽药可能残留到食品中，如牛奶、鸡蛋、鱼、肉和蜂蜜，世界各国的政府机构都采取严格的监管和监测措施。安捷伦高灵敏的质谱解决方案提供复杂样品基质中兽药残留或其代谢物的快速而可靠的分析。
