保护柱所谓保护柱，即在分析柱的入口端，装有与分析柱相同固定相的短柱(5~30mm长)，其作用是收集、阻断来自进样器的机械和化学杂质，以保护和延长分析柱的使用寿命。现在市场上供应的结构新颖可更换柱芯式设计的保护柱，由保护柱套和可更换的保护柱芯两部分组成。
采用保护柱会使分析柱损失一定的柱效，因此选择保护柱的原则是在满足分离要求的前提下，尽可能选择对分离样品保留值低的短保护柱。保护柱装填的填料较少，价格较低，为消耗品，通常可分析50~100次样品，柱压力降呈现增大的趋势就是需要更换保护柱的信号。
那么，液相色谱保护柱如果装反了，会产生什么后果呢？
有两种情况：
一种是保护柱是新柱，那即便装反，也没太多影响。
另一种是保护柱是用过一般时间后，再装反了的，这个情况估计会将分析柱柱头堵塞，看看系统的压力是否有明显比以往增大，如果系统压力与以往差不多，那应该没啥大问题
另外，很多时候，就算是分析柱，有时候柱子给堵塞了，一般的改决方法是反接分析柱进行适当的冲洗，因此，保护柱装反，不会有太多不良后果。
