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干细胞转染及基因编辑,一篇讲透!

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2023/11/9 17:21:27

目前有多种方法可以将基因导入真核细胞内,一般可分为病毒类载体技术和非病毒类载体技术,后者具有低毒性和低免疫反应的特点,且不受细胞或种属特异机制和导入片段大小等限制的优势。其中,电穿孔法以其较高的转染率而备受关注。电穿孔法是应用短暂的高压电流脉冲诱导活细胞产生跨膜电位,由于外加电场强度大于细胞膜穿孔的临界值,引起细胞质膜结构暂时性改变,形成纳米级微孔,DNA等外源物质通过这些微孔进入细胞质或细胞核。

大多数细胞通过传统转染技术就可以提高转染效率,而原代细胞、免疫细胞、神经细胞、干细胞等难以通过传统方法获得高转染效率,成为困扰科研人员的难题。NEPA GENE公司在细胞转染和融合领域拥有超过二十年的研究经验,其代表产品NEPA21高效基因转染系统自上市以来受到了国内外众多科学家的青睐。在干细胞转染方面,如iPS、ESC、HSC和MSC等细胞,NEPA21均被研究者们用于转染实验中,积累了丰富的转染条件、细胞转染效率和基因编辑效率等宝贵的经验和数据。


案例一 使用NEPA21电转染仪将mRNA导入hESC

参考文献:Gene Manipulation of Human Embryonic Stem Cells by In Vitro-Synthesized mRNA for Gene Therapy

转染物质:GFP / DsRed mRNA

电转参数:电压125V(文中只写明电压,详细参数可咨询)

在本研究中,作者通过体外转录合成多种类型的mRNA,使用NEPA21电转仪将其导入到hESC中,以研究mRNA在hESC中的转染效率和诱导蛋白表达的时间(图1)。同时,为了保证转染效率对HN4细胞系不具有特异性,作者对多种hESC细胞系和iPS的转染效率进行了比较。在电穿孔24h后,FCAS分析显示,GFP mRNA在HN4、NS1、NS2和iPS中表达量均在95%以上(图1)。

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图1 电穿孔24h后,GFP在不同细胞系中的转染效率

在电穿孔后,是否能维持胚胎干细胞的多能性仍需要进一步的检测。在此,研究人员通过免疫荧光法检测了两种常见的标志基因(Oct4和SSEA4)。结果显示,转染24h后,大多数表达GFP的细胞仍然呈Oct4阳性和SSEA4阳性。

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图2 电穿孔24h后,HN4细胞中Oct4和SSEA4基因的表达

此外,研究人员还证明采用电穿孔法可以有效地将GFP和DsRed mRNA共转染至HN4细胞中(图3)。

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图2 GFP和DsRed mRNA共转染

案例二  使用NEPA21进行iPSC电转及基因编辑(CRSIPR/TALENs)

参考文献:

1.Precise correction of the dystrophin gene in duchenne muscular dystrophy patient induced pluripotent stem cells by TALEN and CRISPR-Cas9.

2. Efficient genomic correction methods in human iPS cells using CRISPR–Cas9 system

转染物质:EGFP质粒、敲除实验(TALENs: 5μg left + 5μg right或CRISPR: 5μg Cas9 + 5μg sgRNA)、敲入实验(5μg donor vector + TALENs(5μg left + 5μg right)或CRISPR(5μg Cas9 + 5μg sgRNA))

电转参数:电压125V、脉冲时长5ms、脉冲次数2

为了在iPS细胞中获得最高的质粒转染效率,研究人员使用EGFP质粒转染了3种iPS细胞系(201B7、404C2、DMD-iPSC),优化脉冲电压、脉冲时间等转染条件。结果如下图所示:

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图4 iPSC转染条件优化

使用NEPA21优化转染条件之后,通过TALEN和CRISPR两种方法对iPSC的DMD基因进行敲除和敲入实验,基因编辑效率如下:

Knockout

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图5 iPSC基因敲除效率

Knockin


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图6 iPSC基因敲入效率


案例三  使用NEPA21进行HSC转染条件优化及基因编辑(CRISPR)

参考文献:Non-viral ex vivo genome-editing in mouse bona fide hematopoietic stem cells with CRISPR/Cas9

转染质粒:CRISPR/RNP

电转参数:穿孔参数(电压100V、脉冲时长5ms、脉冲次数8)、转移参数(电压10V、脉冲时长50ms、脉冲次数5),本文使用1mm间隔电转杯

在这项研究中,研究者旨在通过连续移植来评估真正的HSCs的基因组编辑效率。为了避免病毒整合到HSC基因组中,采用了非病毒转染方法(电穿孔)来编辑小鼠HSC的基因组。首先通过电穿孔将Cas9/RNP转移到体外的HSC中,随后通过三次细胞移植来检验真正的HSC的敲除效率。此外,通过基因插入,还成功地证明了对小鼠HSCs中X-SCID突变的基因校正,从而治愈了小鼠。

研究人员首先以GFP为报告基因,通过NEPA21在小鼠骨髓系阴性细胞(Lin-)中优化了电穿孔条件,并通过GFP荧光和7-氨基-放线jun素D(7-AAD)染色检测细胞转染效率和细胞存活率。结果显示,在电压100V、脉冲时间5ms、脉冲次数8次的电转条件下,细胞转染效率>60%,存活率>50%,可作为后续实验的电穿孔参数(图7

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图7 HSC转染效率

随后,将针对Itga2b基因外显子1和2的RNP复合体电穿孔转染至Lin-细胞。在体外培养1~2周后,通过Surveyor实验检测到Itga2b外显子1和2的突变,并且将基因编辑后的Lin-细胞通过连续移植后仍能检测到15%定点突变效率,证明了基因编辑发生在真正的HSC中(图8)。



图8 在HSC中敲除Itga2b结果

为了恢复X-SCID小鼠的IL2RG基因功能,研究者采取了基于NHEJ和同源无关的靶向整合(HITI)的策略,将IL2RG外显子2-8(HITI-cDNAex2-8)整合到IL2RG的内含子1。他们先在NIH3T3细胞中测试了该方法,通过NEPA21电转仪导入IL2RG内含子1的gRNA与Cas9(Cas9/RNP-Il2rgin1),在NIH 3T3细胞中有效地产生了43.1%的突变。基于此,进一步检测了在Lin-细胞中的基因插入效率,通过Surveyor分析和扩增序列测定,细胞基因突变效率为20.2%(图9)。

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图9 在HSC中对IL2RG基因插入结果

本文中提到,Cas9/RNP通过电穿孔到造血干细胞,可以不使用任何病毒载体,基因编辑技术为基因位点的特异性修饰提供了可能。非整合病毒如腺病毒或腺相关病毒(AAV)经常被用来传递CRISPR/Cas9,但它们会在宿主中激发对组成性表达的Cas9的免疫反应。相反,Cas9/RNP在转导细胞中迅速降解,从而逃避宿主的免疫反应,更重要的是,电穿孔与其他传递方法相比,产生的脱靶DSB更少。


案例四  使用NEPA21电转MSC的最佳条件

参考文献:电穿孔法转染脐带华通胶间充质干细胞的最佳条件

转染物质:EEV-EGFP质粒

电转参数:电压150V、脉冲时长5ms、脉冲间隔50ms、脉冲次数2

本文采用电穿孔法将质粒EEV-EGFP转入华通胶间充质干细胞(WJ-MSC),并通过流式细胞仪检测转染率,以探讨不同电穿孔条件对WJ-MSC转染效率的影响,确定最佳电转染条件。

研究人员测试了不同电压(125,130,140,150,170V)、不同脉冲时间(2.5,5.0,7.5ms)、不同细胞状态(体积分数为20%正常氧、体积分数为5%低氧)对WJ-MSC电转染效率的影响。电穿孔后48h进行检测,转染质粒携带EGFP绿色荧光标签,转染成功的WJ-MSC将表达绿色荧光蛋白,使用流式细胞仪检测荧光表达率。

结果表明,正常培养的WJ-MSC在电压150V、脉冲时长5.0ms、脉冲间隔时间50ms、脉冲数2次时可达到较高的电转染率。

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图10 不同转染条件下WJ-MSC的转染效率

总结

较高的电穿孔条件可以更有效地编辑基因组,但会对细胞造成较大损伤,而较弱的电转染条件对细胞更温和,但细胞转染效率和编辑效率可能较低。因此,为基因组编辑效率和细胞活力找到一个可接受的条件是十分重要的。NEPA21采用全新四步法电转程序,可对细胞穿孔模式和基因转移模式中的所有参数进行单独设置(电压、脉冲时长、脉冲间隔、脉冲次数和衰减比例),非常有利于难转染细胞的参数优化,提高转染效率。

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NEPA21高效基因转染系统采用全新设计的电转程序,配合电压衰减设计,在获得高转染效率的同时,提高细胞存活率。操作简单,电转参数可见可调,适用性强。特别适用于难转染的原代免疫细胞、干细胞、神经细胞、外泌体、类器官、活体动物、受精卵及宫内胚胎等的转染,已应用于众多著名期刊文献中,是进行细胞悬浮/贴壁状态、活体和离体组织转染的电转系统主流品牌之一。

本文引用的案例均为已发表文献,想了解NEPA21更多应用案例或实验细节可咨询。


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END

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