在选择色谱柱之前，先多了解自己的样品和杂质，他们的类型结构、极性、酸碱性、分子量大小等等。
1.样品是极性的且弱酸性的；就可以选择C18在100%酸性水溶液条件下检测，即要选择承受100%纯水且对极性化合物保留很好的色谱柱
2.如果样品极性太强，或酸性太强；可以选择CN，NH2，或硅胶柱，HILIC（亲水色谱），也有使用C18+强阴离子对试剂或强阴离子交换色谱柱（缺点是离子对试剂平衡时间长，对流动相pH要求比较精密，否则很难重复实验，另外离子对试剂很难洗下来，基本上用了离子对的色谱柱就不能再用于其它实验）
3.若样品是碱性的；可选择高纯硅胶柱（高纯硅胶缺少金属杂质，且硅胶端基封尾）或一些经过修饰的C18柱（如极性嵌入技术或碱去活技术等），他们都会减少碱性化合物的拖尾，一般会选择中性或偏碱的条件下做，因为这样可增加碱性样品的保留
4.如果碱性化合物的极性太强，或碱性太强；可以选择宽pH的C18色谱柱在高pH值检测（优点是方法开发简单，缺点是目前实现这一技术的色谱柱品牌比较少，价格也高）或者选用HILIC色谱柱（硅胶柱在反相条件下使用，这也是很经典的检测碱性样品的方法）选择强离子交换柱（缺点是不能用来分析其它样品，对流动相pH要求比较精密，否则很难重复实验）也有使用C18+强阴离子对试剂或强阴离子交换色谱柱
液相色谱柱是用于分离、纯化和检测混合物中化学成分的重要工具。其主要特点如下：
分离效果好：液相色谱柱可以分离复杂的混合物，因为它们具有高分辨率和选择性。这些特性源自于柱填料的多样性、柱径、长度以及使用的溶剂系统等因素。
操作简便：相对于其他色谱技术，液相色谱柱操作简单易学，只需掌握一些基本技能即可使用。此外，它还允许在线监测和数据记录。
处理大样品量：液相色谱柱可以处理大样品量，从毫升到升级别。这使得它在生产环境中特别有用，可以快速分离和纯化大量的产品。
高灵敏度：由于液相色谱柱通常与检测器相结合，因此它可以实现高灵敏度的定量和定性分析。同时，现代检测器的发展提高了其灵敏度和选择性。
应用广泛：液相色谱柱在化学、药学、食品科学、环境监测等领域中应用广泛。它们可以用于分离有机和无机化合物、生物大分子以及各种杂质。
