除湿机和空调器的除湿方式不同。空调器通过使整个空间的温度下降来除湿，而除湿机是通过热交换原理将空气中的水分冷凝成水珠排出机外，从而达到除湿效果。因为除湿机排出的是暖风，环境温度反而会略微上升，但温差不会很明显。
另外，空调器的主要功能是制冷和制热，带独立除湿功能的空调器可以除湿，但除湿量小、除湿慢。而且南方地区的梅雨季节，温度都较低，大部分时间都在20℃以下，这时的空调器除湿吹出的是冷风，越除湿越冷，给人的感觉相当不舒服。此外，由于空调器是固定的只能在局部小面积范围除湿，更重要的是当空凋器除湿时增加了几倍的负荷运行，不但耗电量大，还使压缩机受损，缩短机器的寿命。因此，空调机不宜代替除湿机使用。
