| 序号 | 实验室名称 | 依托单位 | 主管部门 |
| 1 | 内蒙古自治区白云鄂博稀土铁铌共伴生矿高效绿色冶金重点实验室 | 内蒙古科技大学 | 内蒙古科技大学 |
| 2 | 内蒙古自治区土木工程绿色建造与智能运维重点实验室 | 内蒙古工业大学 | 内蒙古工业大学 |
| 3 | 内蒙古自治区矿业工程重点实验室 | 内蒙古科技大学 | 内蒙古科技大学 |
| 4 | 内蒙古自治区新能源电力系统智慧控制重点实验室 | 内蒙古工业大学 | 内蒙古工业大学 |
| 5 | 内蒙古自治区智能感知与系统工程重点实验室 | 内蒙古工业大学 | 内蒙古工业大学 |
| 6 | 内蒙古自治区先进永磁电机及其控制技术重点实验室 | 包头长安永磁电机有限公司 | 包头市科学技术局 |
| 7 | 内蒙古自治区土木工程安全与耐久重点实验室 | 内蒙古科技大学 | 内蒙古科技大学 |
| 序号 | 实验室名称 | 依托单位 | 主管部门 |
| 1 | 内蒙古自治区生物制造技术重点实验室 | 内蒙古农业大学 | 内蒙古农业大学 |
| 2 | 内蒙古自治区动物传染病疫苗与诊断试剂工程技术重点实验室 | 金宇保灵生物药品有限公司 | 呼和浩特市科学技术局 |
| 3 | 内蒙古自治区细胞分子调控重点实验室 | 内蒙古大学 | 内蒙古大学 |
| 4 | 内蒙古自治区生命健康与生物信息学重点实验室 | 内蒙古科技大学 | 内蒙古科技大学 |
| 5 | 内蒙古自治区微生物代谢与绿色发酵工程重点实验室 | 内蒙古阜丰生物科技有限公司 | 呼和浩特市科学技术局 |
| 序号 | 实验室名称 | 依托单位 | 主管部门 |
| 1 | 内蒙古自治区核医学与分子影像学重点实验室 | 内蒙古医科大学 | 内蒙古医科大学 |
| 2 | 内蒙古自治区虫媒人兽共患传染病重点实验室 | 河套学院 | 巴彦淖尔市科学技术局 |
| 3 | 内蒙古自治区口腔颅颌面疾病研究重点实验室 | 赤峰学院 | 赤峰市科学技术局 |
| 4 | 内蒙古自治区呼吸疾病重点实验室 | 内蒙古自治区人民医院 | 内蒙古自治区卫生健康委员会 |
| 5 | 内蒙古自治区疾病相关生物标志物重点实验室 | 内蒙古科技大学包头医学院 | 包头市科学技术局 |
| 6 | 内蒙古自治区风湿免疫性疾病发病机制与免疫诊断重点实验室 | 内蒙古医科大学 | 内蒙古医科大学 |
| 7 | 内蒙古自治区过敏性疾病重点实验室 | 呼和浩特市第一医院 | 呼和浩特市科学技术局 |
| 8 | 内蒙古自治区代谢病调控与生物治疗重点实验室 | 内蒙古自治区人民医院 | 内蒙古自治区卫生健康委员会 |
| 9 | 内蒙古自治区内镜消化疾病重点实验室 | 内蒙古自治区人民医院 | 内蒙古自治区卫生健康委员会 |
| 10 | 内蒙古自治区分子病理学重点实验室 | 内蒙古医科大学 | 内蒙古医科大学 |
| 11 | 内蒙古自治区蒙医药标准化重点实验室 | 内蒙古民族大学 | 内蒙古民族大学 |
| 12 | 内蒙古自治区中蒙药药效物质研究重点实验室 | 内蒙古医科大学 | 内蒙古医科大学 |
| 13 | 内蒙古自治区特色道地药材资源保护与利用重点实验室 | 内蒙古科技大学包头医学院 | 包头市科学技术局 |
| 14 | 内蒙古自治区蒙药传统制剂二次开发重点试验室 | 内蒙古蒙药股份有限公司 | 通辽市科学技术局 |
| 15 | 内蒙古自治区药品标准研究与质量评价重点实验室 | 内蒙古自治区药品检验研究院 | 内蒙古自治区药品监督管理局 |
| 16 | 内蒙古自治区天然产物化学及功能分子合成自治区重点实验室 | 内蒙古民族大学 | 内蒙古民族大学 |
| 17 | 内蒙古自治区医药化工技术企业重点实验室 | 赤峰艾克制药科技股份有限公司 | 赤峰市科学技术局 |
| 18 | 内蒙古自治区蒙药配方现代化研究重点实验室 | 内蒙古医科大学 | 内蒙古医科大学 |
| 序号 | 实验室名称 | 依托单位 | 主管部门 |
| 1 | 内蒙古自治区微尺度物理与原子制造重点实验室 | 内蒙古大学 | 内蒙古大学 |
| 2 | 内蒙古自治区数学建模与科学计算重点实验室 | 内蒙古大学 | 内蒙古大学 |
| 3 | 内蒙古自治区应用凝聚态物理重点实验室 | 内蒙古师范大学 | 内蒙古师范大学 |
| 4 | 内蒙古自治区生物物理与生物信息学重点实验室 | 内蒙古大学 | 内蒙古大学 |
| 序号 | 实验室名称 | 依托单位 | 主管部门 |
| 1 | 内蒙古自治区沙地（沙漠）生态系统与生态工程重点实验室 | 内蒙古自治区林业科学研究院 | 内蒙古自治区林业和草原局 |
| 2 | 内蒙古自治区蒙古高原地理研究重点实验室 | 内蒙古师范大学 | 内蒙古师范大学 |
| 3 | 内蒙古自治区河流与湖泊生态重点实验室 | 内蒙古大学 | 内蒙古大学 |
| 4 | 内蒙古自治区土壤质量与养分资源重点实验室 | 内蒙古农业大学 | 内蒙古农业大学 |
| 5 | 内蒙古自治区岩浆活动成矿与找矿重点实验室 | 内蒙古自治区地质调查研究院 | 内蒙古自治区自然资源厅 |
