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环状RNA芯片定制检测服务
上海研谨生物科技有限公司提供RT-PCR技术服务、细胞培养技术服务、原位杂交技术服务、免疫沉淀技术服务、Western Blotting技术服务、PCR实验服务，并为广大科研用户提供各种高品质的化学试剂、生物学试剂、免疫学检测，ELISA试剂盒、生化试剂盒、分析标准品、对照品、标准物质、食品安全检测试剂、动物疫病类检测产品、兽药残留检测试剂、细胞培养服务等，应用覆盖药物分析领域、食品安全领域、聚合物研究领域、环境监测领域，客户广泛分布于食品、制药、第三方检测、环境测试机构、化工、科研院校、生物工程等行业。
针对以上各项服务，我们均有丰富服务经验和深厚专业背景的人员团队为您提供技术和支持。上海研谨生物拥有充满活力的团队，持续创新，致力于为客户提供高质量产品和优质的服务。
详细信息
环状RNA芯片定制检测服务
实验技术简介: 环状RNA (ircRNA) 是区别于传统线性RNA的一类新型RNA,具有闭合环状结构,大量存在于真核转录组中。大部分的环状RNA是由外显子序列构成，在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状RNA对核酸酶不敏感，所以比线性RNA更为稳定， 这使得环状RNA在作为新型诊断标记物的开发应用上具有明显优势。近来研究显示，环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用,称之为竞争性内源RNA (ceRNA) ， 能竞争性结合miRNA。而与疾病关联性miRNA的相互作用说明环状RNA对疾病的调控起着非常重要的作用。
实验操作流程:
1、样品RNA抽提
2、RNA质量检测
①使用Nanodrop测定RNA在分光光度计260nm、280nm和230nm的吸收值，以计算浓度并评估纯度。
②用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳，检测RNA纯度及完整性。
③提供RNA QC报告。
3、RNase R处理
4、cDNA/aRNA样品合成和标记
5、标记效率质量检测使用Nanodrop检测荧光标记效率，标记效率合格以保证后续芯片实验结果的可靠性。
6、芯片杂交
在标准条件下将标记好的探针和高密度基因组芯片进行杂交。
7、图像采集和数据分析
使用GenePix 4000B芯月扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数字型数据保存，使用配套软件对原始数据进行分析运算。
8、提供实验报告
①Scanning Image: Cy3荧光扫描图像;
②Scatter Plot:散点图，X轴为Control信号值，Y轴为Experiment信号值， 表示信号数据总体分布趋势;
③Raw Data:探针的扫描荧光信号强度原始数据;
④Normalized Data:经过统计学方法标准化后数值;
⑤P-value: T-test统计分析显著差异表达的基因，p-value越小， 该circRNA在两组样本间差异表达越显著
⑥significant Up & Down Regulated CircRNA List:显著差异表达的circRNA列表包含Fold Change, p-valuel以及circRNA的详细注释信息(相应的线性mRNA和miRNA结合位点)。
客户提供:
1、实验对象为组织样品，取适量(50-100mg) 新鲜组织样品或正确保存的组织样品，使用
BioPulverizer TM冰冻粉碎组织，加1m的RNA抽提试剂TRIzol (Invitrogen) ，使用Mini-Bead-Beater-16匀浆后抽提RNA。
2、实验对象为细胞样品，每份样品取1x106~ 1x107细胞，加1m的RNA抽提试剂TRIzol (样品为贴壁细胞，每10cm2培养皿TRIzo1使用量为1ml)，裂解后抽提RNA。
交付标准:
1、芯片检测数据
2、完整的实验操作规程、实验报告(含软件分析结果)以及实验材料
实验代做服务：
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