Fragment Analyzer 全自动毛细管电泳仪是由美国AATI公司研发生产的新型突变检测及核酸片段分析系统。此系统是基于荧光检测技术和毛细管电泳技术发展而来的新型DNA/RNA段分析仪器，它采用敏感的嵌入染料以及强大的LED光源，相较于传统方法系统检测灵敏度高、分辨率强、通量大和分析速度快。

Fragment Analyzer 全自动毛细管电泳仪采用并行毛细管电泳（CE）与荧光检测技术相结合，能够对DNA和RNA电泳分离检测。毛细管列阵是并行毛细管电泳的基础，根据毛细管列阵的毛细管数量分为96和12通道，每个毛细管首先注入可导电的分离胶，然后对毛细管两端施加电场，96孔板中的预检测样品开始毛细管电泳。依据核酸片段长度不同在凝胶电泳中迁移速度不同的原理核酸样品被分离检测。当毛细管中核酸片段通过位于LED和CCD探测器组件之间的检测窗口时被实时检测。核酸检测组件是由一个LED光源（470纳米激发）、照相机镜头和CCD探测器组成的光学平台。LED光源（470纳米激发）激发核酸样品中的嵌入染料产生荧光信号，然后通过相机镜头和特定的滤光器立体成像到CCD检测器，把实时荧光信号转换为实时电信号被软件实时读取，由此测绘每个样品完整的核酸片段分布峰图。