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单细胞可视化分选系统——isoPick

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参数
产地类别:进口
QUANTUM量子科学仪器贸易(北京)

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详细信息

单细胞可视化分选系统——isoPick

单细胞可视化分选系统——isoPick是英国iotaSciences公司新推出的一款基于GRID技术、高通量、高自动化的单细胞可视化分选系统。isoPick采用微射流技术,利用界面张力对细胞培养基(或干细胞涂层)进行重塑,在培养皿上雕刻出单独的细胞腔室GRID。isoPick可以在 6 厘米培养皿上创建 256 个单细胞腔室GRID阵列,并将细胞以纳升体积全自动地分配到各个 GRID 单细胞腔室中,通过isoPick的光学显微镜可以清楚地看到 GRID 室中的单细胞。基于GRID技术和光学成像信息,isoPick可以确保分选出的细胞100%为单细胞。

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设备特点

- 全自动化流程

- 操作简单,对细胞无损伤

- 结果可追踪

- 分离效率高达100%

- 直接转移到PCR管或96孔板

- 结构紧凑,体积小


传统单细胞分离手段无法保证所得的样品内只有一个单细胞,有可能有多个细胞或细胞团,导致下游的实验出现误差。单细胞可视化分选系统—isoPick采用的GRID技术结合图像信息分析,结果可追踪,保证100%准确的单细胞分选。而且isoPick分选条件温和,可以显著提高分选单细胞的存活率。同时isoPick可将单细胞样品按照特定的体积直接转移到96孔板或PCR管中,无缝衔接单细胞下游应用,确保后续单细胞组学信息完整性。


应用领域


单细胞分选

单细胞克隆

单细胞组学


100%准确的单细胞分选效率

显著提升单细胞克隆的存活率(单克隆率)

极大地简化单细胞组学步骤

技术优势

传统单细胞分选方法无法保证所得的样品中只有一个单细胞,而isoPick采用GRID单细胞腔室分离与光学信号验证相结合的分选技术,能够保证分选所得的单细胞样品中只有一个单细胞。

isoPick可以高效分离hiPSCs单细胞,用于构建单克隆细胞系。isoPick对敏感单细胞处理温和,能够确保更高的单细胞存活率,达到更佳的克隆生长效果。

isoPick可以将1.5~200 µl的单细胞样品直接转移至PCR管带或96孔板中,无缝衔接后续单细胞测序scWGA流程,极大地简化单细胞组学步骤。


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单细胞分选前后的GRID细胞腔室

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包被不同基质的96孔板的单细胞hiPSC集落

8.2.2.3.png

单细胞的WGA结果


部分用户单位


8.2.3.1.png


部分应用案例


人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的单细胞克隆

人类诱导多能干细胞(hiPSCs)构建单克隆细胞系培养步骤繁琐,细胞对异常的处理和操作非常敏感,传统单细胞分选容易导致细胞和遗传毒性应激的积累,进而导致不良分化和多能性丧失。

使用isoPick可以温和、自动地将人类诱导多能干细胞(hiPSCs)进行单细胞分选,以高效率培养hiPSCs单克隆细胞系,显著提高了细胞分离与克隆效率。

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K562细胞单细胞测序

传统单细胞测序需对单细胞进行全基因组扩增(WGA),但传统单细胞WGA受限于如何获得单个细胞并转移到小体积的WGA反应中。

使用isoPick自动将K562细胞拾取并转移至含3.5 µl scWGA试剂的PCR管中,并无缝衔接scWGA反应。琼脂糖凝胶电泳结果显示(下图),单细胞WGA的DNA样本(+)中两种基因均被特异性扩增,而阴性对照(-)没有这两种扩增产物,符合预期。

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对人类诱导多能干细胞 (hiPSCs) Prime 编辑构建工程细胞系

Prime 编辑可在 HEK3 基因座中高效精确插入三个核苷酸,用于构建工程细胞系hiPSCs。通过引入靶标特异性 pegRNA 来编辑单个或多个基因组位点,以进行精确有效的基因组编辑,促进疾病建模和功能遗传学研究。

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Prime 编辑使用与逆转录酶融合的 Cas9 切口酶,将 DNA 序列从“Prime 编辑”引导 RNA (pegRNA) 复制到特定基因座。通过Prime 编辑将多西环素诱导型 Prime Editor 蛋白 (PE2) 整合到 iPSC 细胞系的AAVS1 基因组,之后使用isoPick分选转入靶基因的hiPSCs细胞系,以确保细胞的单克隆性。(见上图)

该研究使用isoPick来确保工程细胞系的单克隆性与准确性。

参考文献:Bharucha N, Ataam J A, Gavidia A A, et al. Generation of AAVS1 integrated doxycycline-inducible CRISPR-Prime Editor human induced pluripotent stem cell line[J]. Stem Cell Research, 2021, 57: 102610.


胶质母细胞瘤(GBM)通过表观遗传免疫编辑获得骨髓相关转录程序以引发免疫逃逸

研究人员通过将多形性胶质母细胞瘤干细胞 (GSC) 连续移植到免疫活性宿主中,发现 GSC 通过建立增强的免疫抑制肿瘤微环境来免疫逃逸。从机制上讲,GSC通过表观遗传免疫编辑过程引起,其在免疫攻击后强制执行 GSC 中稳定的转录和表观遗传变化。研究中使用Irf8敲除细胞系实验证明,Irf8的激活是细胞免疫逃逸的一个重要因素,且在体内可能通过IFNγ介导的激活发生。该研究使用isoPick构建Irf8克隆敲除系。

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参考文献:Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell。


此产品不用于医疗及临床,仅用于科研或动物实验


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