尽管进行了大量研究，但事实证明分离纯净的细胞外囊泡 (EV) 制剂仍具有挑战性。在此，我们比较了离子交换色谱法（IEC）和广泛使用的蔗糖密度梯度离心法（SDG）来纯化EVs。通过差速离心法从汇集的正常人羊水（AF）中分离出大量的EVs，然后进行IEC或蔗糖密度梯度分离。通过电泳和凝集素印迹/免疫印迹来监测总蛋白、不同的EVs标记物和选定的N-聚糖的分布，从而评估分离出的EVs的纯度。我们的数据显示，带负电荷的 EV 与其他带不同电荷的分子能有效分离，而使用 SDG 离心法对 EV 进行的比较分析表明，阴离子交换色谱法在 EV 纯化方面具有优势。最后，虽然这种基于 IEC 的方法是通过 AF 验证的，但该方法也可用于从其他来源分离 EVs。