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WinCELL系统
高级会员第16年
代理商北京易科泰生态技术有限公司成立于2002年,为中关村高新技术企业,致力于生态-农业-健康研究监测技术推广、研发与服务,特别是在光谱成像技术(高光谱成像技术、叶绿素荧光成像技术、红外热成像技术、无人机遥感等)、植物表型分析技术、呼吸与能量代谢测量技术等方面,与专业企业PSI、Specim、Sable等合作,致力于植物科学、土壤与地球科学、动物能量代谢、水体与藻类及生态环境领域先进仪器技术的引进推广和技术研发集成,为植物/作物表型分析、生态修复及生态保护、能量代谢测量等提供规划设计、技术方案与系统集成、技术咨询与科技服务。公司技术团队80%以上具备硕士或硕士以上学位,并与*研究生院、中科院植物研究所、中科院动物所、中科院地理科学与资源研究所、中国农科院、中国林科院、中国环科院、中国水科院、清华大学、中国农业大学、北京林业大学、北京大学、中国海洋大学、陕西师范大学、内蒙古大学等建立了长期的技术合作交流关系。
公司下设有叶绿素荧光技术与植物表型业务部、EcoTech®实验室、光谱成像与无人机遥感事业部及无人机遥感研究中心(与陕西师范大学合作建立)、动物能量代谢实验室、内蒙古阿拉善蒙古牛生态牧业研究院及青岛分公司。实验室拥有叶绿素荧光成像、叶绿素荧光仪、水体藻类荧光仪、SPECIM高光谱仪、WORKSWELL红外热成像仪、EasyChem全自动化学分析仪、MicroMac1000水质在线监测系统、ACE土壤呼吸自动监测系统、SoilBox便携式土壤气体通量测量系统、动物呼吸测量系统、LCpro 光合作用测量仪、Hood土壤入渗仪、年轮分析仪等各种仪器设备,可以进行实验研究分析、实验培训等,欢迎与易科泰生态研究室开展合作研究。
易科泰公司与欧洲PSI公司(叶绿素荧光技术与表型分析技术)、美国SABLE公司(动物能量代谢技术)、欧洲SPECIM公司(高光谱成像技术)、欧洲WORKSWELL公司(红外热成像技术)、欧洲ATOMTRACE公司(LIBS元素分析技术)、欧洲BCN无人机遥感中心、欧洲ITRAX公司(样芯密度扫描与元素分析)、美国VERIS公司、英国ADC公司、德国UGT公司、欧洲SYSTEA公司等著名生态仪器技术领域的研发机构和厂商建立了密切的合作关系,在FluorCam叶绿素荧光成像与荧光测量技术、PlantScreen植物表型分析技术、高光谱成像技术、红外热成像技术、光合作用与植物生理生态研究监测、土壤呼吸与碳通量研究监测、动物呼吸代谢测量、水质分析与藻类研究监测、CoreScanner样芯密度CT与元素分析技术、LIBS元素分析技术、无人机生态遥感技术等生态仪器技术及其系统方案集成有着丰富的经验,成为我国农业、林业、地球科学、生态环境研究等领域科技进步的重要研究技术支持力量。由公司研制生产的EcoDrone®无人机遥感平台、SoilTron®多功能小型蒸渗仪技术、SoilBox®土壤呼吸测量技术、PhenoPlot®轻便型作物表型分析系统、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度监测系统、植物生理生态监测技术、动物能量代谢测量技术等,在中科院修购项目、*学科群项目、CERN网络(生态系统监测网络)等项目中发挥重要作用。
“工欲善其事,必先利其器”,易科泰公司将秉承“利其器,善其事”的经营理念,为国内生态-农业-健康研究与发展提供优秀的技术方案和服务。
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一、简介
WinCELL是一种特别设计用来分析树木细胞的图像分析系统 它可以量化年轮上树木结构的变化。
解剖学树木细胞分析可用X射线进行树木密度分析(例如WinDENDRO)。木材密度、色彩、机械和化学性质都受到树木树轮结构的影响,而该结构又与环境气候有关。通过测量辐射细胞(管胞)的尺寸、分布以及到内壁的比例,木材的质量可以评估出来。
WinCELL使用显微镜用薄片切片机产生的木材样品切片,或者,对于如同落叶类植物春材导管这类大细胞,可直接从木材表面*获得样品来测量树木细胞的形态。树木细胞的形态数据可以使用数据快速处理和可视化的伴侣软件XLCell来对每个轮圈的1个或多个图像上的每个年轮进行测量。
一般图像分析者不会特地对树木细胞进行测量,通常测量所产生的数据都不适合于树木年代学研究。这些系统都缺乏关于树木年轮形成及其细胞结构(例如计算树轮宽度)的知识,因此它们都不知道在这个领域如何进行测量。WinCELL则知道如何去做,例如两个相邻细胞间的细胞壁必须一分为二来计算细胞的长度和春材或树轮宽度,其通用设置可以用来分析不同类型的树木(落叶类植物导管和针叶类管胞的放射状排列)。它支持全自动和交互式分析模式,后者允许用户选择细胞行列以模拟传统管胞**的方法进行分析。
WinCELL可以处理不完整的细胞,它们会被图像边界删除,因此不会对平均的细胞测量产生影响。
* 使用适当的图像捕获装置和样品制备。
** 年轮中不同功能位置的放射细胞尺寸的曲线图表。
图像捕获
近年来发展出的高质量数码相机使解剖学树木细胞分析较以往更容易实现。
样品制备
木材细胞分析通常通过显微镜用薄片切片机产生的木材样品切片来进行。有时通过染色来提高内腔的对比度。在适当的准备和照明下,大的导管可从木材表面进行直接分析。
显微镜
为了获取显微镜用薄片切片机产生的木材样品切片的图像,需要有带有可以安装相机的附件插管和C-安放适配器(由显微镜制造商提供)的显微镜。
相机
WinCELL 可以分析由数码相机或模拟相机捕获的图像。由Regent销售的型号都是科研等级并且都有可以安装在显微镜上的标准C-安放螺纹。 我们销售从1到6兆像素(百万像素)的三种型号的相机,这些相机可以直接安装在木片上方(带有光学透镜)。样品表面被很好地制备,WinCELL也可以从光学扫描仪获取图像(选购前请查询条件)来分析大细胞(导管) 。由Regent 销售的相机可以通过“火线”(IEEE-1394)或USB2.0 接口连接到计算机上。WinCELL是TWAIN兼容产品,这意味着它可以从很多种相机和扫描仪获取图像。
从WinCELL获取的图像
当用户调整显微镜或样品位置时,简单地点击WinCELL 软件窗口中的图标就可以在计算机的显示屏上实时显示图像(或半实时显示图像,依据相机类型)。当图像显示后,用户也可以设置图像参数(尺寸、色彩、过滤器)。要数字化和分析图像,只须简单地点击相机界面窗口中的按钮。
二、WinCELL全系统组成:
·带有彩色说明书的WinCELL 标准或加强版软件
·灰度或彩色“火线”或USB 2.0相机,分辨率1、3或6百万像素,2米连接缆线
·数据分析和可视化XLCell 伴侣软件
·产品终止后zui长2年免费
·系统不包括: 相机用C-安放适配器,这些适配器应该由显微镜厂商提供; 相机镜头(在显微镜上的相机无须镜头,但不使用显微镜而做其它应用时需要镜头)
WinCELL相机和可选件:
·数字“火线”相机,分辨率1、3或6百万像素,2米连接缆线
·“火线”卡,安装在无“火线”连接器的PC的PCI插槽上
可选:
·“火线”缆线4.5米或10米
·大镜头,可用于诸如叶面积测量等其它应用
可通过不同的方式进行细胞形态学测量:自动、半自动或手动(交互式)
分析区域
分析样品的*步是选择分析区域。所有的版本仅能分析整体图像,而加强版可以对任何形状的区域进行分析。在右图的示例中,创建了分析区域(绿线内部分)仅对属于特定年轮的春材导管进行分析。这些区域可以很容易地通过在图像上描画轮廓来选定。指令可以快速、容易地创建矩形和圆形的分析区域。
内腔和外壁面积
内腔面积自动测量并且是真实测量面积(基于其内包含的像素数量)而并非由直径估算。内腔基于它们的面积可以被分成细胞和导管群,那些大于值的被归类到导管,小于值的被归类到细胞,两个族群可以分别分析(可以获得两者总体和个体的数据)。用户可以简单地通过按键和点击目标来进行重新分级。外壁面积通过计算分析区域中属于外壁的像素等级面积来自动计算。
内腔和外壁面积用于被分析区域的总值(测量单位和被分析区域面积的百分比),内腔面积还作为基于单独分析数据中的单另细胞或导管。
内腔面积色彩功能
除去细胞和外壁面积以外,加强版还可以利用色彩功能测量整个分析区域或部分区域(每个细胞)的内腔和外壁面积。
管胞长度和宽度
管胞长度和宽度(或径向和纵向直径)可以用不同的方式进行计算。
细胞位置
在图像上,细胞的中心位置可以被测量,该位置与年轮起始有关。后者可以用来对年轮上功能位置的细胞结构参数分布进行统计学计算。
管胞数量(细胞和导管)
在被分析区域或在迹线路径中的细胞和导管可以被自动计数。
上面提及的形态学测量,在整个分析区域或通过交互式测量选定的细胞,都可以自动进行计算。在自动模式,用户所要做的事情只是点击图像或指示出分析区域和被分析区域中包含的细胞。在交互式方式,用户简单地画一条穿过细胞的线来测量。后者通常用来分析径向细胞行列(与年轮边界位置相关的细胞排列是*的)。
交互式测量模式有4种设置
在*手动模式中,不会自动对图像进行分析。此模式被用于测量任何用手简单地在末端点击的对象。它可以用来测量细胞长度或用来对完整的纤维长度进行阐述。平直的对象可以通过在其末端点击两次进行测量,弯曲的对象可以通过在其曲率的变形点上额外点击鼠标进行测量。另外的手动模式用来成对测量对象的长度和宽度(可在之后估算面积),还可以在对比度达不到自动分析要求时对细胞进行测量。
两种半自动测量模式可以用来测量细胞长度和它们相邻的两个壁厚(在内腔的对侧)。一种模式在迹线方向上进行,另一种模式在放射状方向上进行。
这两种半自动测量方法也可以得出放射状细胞行列的长度(介于年轮分界线和轮宽度之间)。
五、产地:加拿大