一般细胞培养多利用两种净化工作台，一种是测流式或称垂直式，另一种是外流式或称水平层流式。

基本原理大致相同，都是将室内空气经粗过滤器初滤，由离心风机压入静压箱，再经过空气过滤器精滤，由此送出的洁净气流从一定的均匀的断面风速通过无菌区，从而形成无尘无菌的高洁净度工作环境。但两种净化台的气流方向不同，侧流式工作台空气净化后的气流从左或右侧通过工作台面流向对侧，也有从上向下或从下乡上流向对侧，都能形成气流屏障保持工作区无菌。但在净化气流和外边气体交界处可因气流的流动出现负压，使少许未净化空气混入，有发生污染的可能。测流式净化台结构较为封闭，一般仅留两个手臂伸入的圆洞，操作和拿取较大物品不够方便。

外流式（水平式）是使净化后的空气面向操作者流动，因而外方气流不致混入操作区，但如进行有害物质实验操作则对操作者不利。水平式净化工作台工作多为开放时，没有防护挡板，虽然操作和拿取物品较为方便，但可能受外界气流的影响而引起不接空气混入。

净化工作台是较为精密的仪器，如果使用和维护得当，可以取得良好的效果并可延长使用寿命。

超净工作台主要是用过滤器来净化空气的，其过滤器是用一定的使用寿命的，需要定期更换。如果本身工作台处于较干净的环境中，如GMP车间内，那更换频率较低；如果只是普通实验室，应2年换一次过滤器，以保证其效果。