本底补偿是在线硅酸根分析仪所*的一项功能。在仪表维护中可以将此项功能设为开或关。设置本底补偿功能的原因是：我们校准仪表所用的标准液是以零硅水为基础的，而在现实当中，根本就没有零硅水的存在，无论我们怎么努力，硅离子还是存在于水中，所以我们所做的标准除了添加的含量外还有水中原本就有的硅含量，即实际的硅离子浓度总比理论的硅离子浓度高，并且由于水中所含硅离子的浓度是一个未知量，所以并不能肯定高出多少，那么在测量时也就不能测得真实的硅含量。