Trizol疑难解答
时间:2010-12-09 阅读:4989
般注意事项:
- Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注意操作。如皮肤接触Trizol,请立即用大量去垢剂和水冲洗,如仍有不适,请听取医生意见。
- RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注意随时勤换手套,样品尽可能盖严;尽量不要对着RNA样品呼气或说话。用0.01%的DEPC水浸泡过夜,然后灭菌,烘干。溶液需用DEPC水配制。加0.01%(体积比) diethyl- pyrocarbonate(DEPC)至重或MiliQ级水中,处理过夜,灭菌即成DEPC水。
- 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不*会降低zui后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
- 酵母和一些细菌由于细胞壁的特殊结构,可以加入TRNzol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。
- TRNzol试剂也适合于样品和组织裂解液的贮存,这尤其适合于同时处理样品较多或操作较为费时时。
一:低得率
A:样品裂解或匀浆处理不*;匀浆不*时,基因组DNA分子仍然很大,溶液粘稠。变性的蛋白质和基因组DNA一起形成絮状凝集物容易包裹RNA,使之不能有效地释放到溶液中。
B:沉淀不*:从小于≤2×105动物细胞、≤2 mg动物组织或RNA含量低的样品中提取RNA时,匀浆体积太大,将造成RNA过分稀释而不能有效地沉淀下来。当从这样的样品中提取RNA时,应按比例减少抽提溶液,异丙醇沉淀后延长冰浴和离心时间,具体实验参数见相应操作步骤。加入少量糖原可提高RNA产量又不影响RT-PCR。
C:zui后得到的RNA沉淀未*溶解
二:A260/A280<1.65
A.检测吸光度时,RNA样品不是溶于TE,而是溶于水。低离子浓度和低pH条件下,A280值会较高。
B.样品匀浆时加的试剂量太少。
C.匀浆后样品未在室温放置5分钟。
D.水相中混有有机相。
E.zui后得到的RNA沉淀未*溶解。
三:RNA降解
A.组织取出后没有马上处理或冷冻;细胞生长过度
B.样品或提取的RNA沉淀保存于-5--20℃,未在-60--70℃保存。
C.细胞在胰酶处理时被破坏或匀浆中组织或细胞成分未*分散,样品中RNA酶未*灭活。。
D.溶液或离心管未经RNase去除处理。Tip头、离心管、贮存管受RNA酶污染。
E.电泳时使用的甲酰氨pH低于3.5
F.样品存放时间太长,裂解液中b-ME不足;
四:DNA污染
A:操作不规范
B.样品中含有组织溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性
溶液。
C.样品匀浆时加的试剂体积太少或样品量太多,污染有机物和中
间相。
D:在转录特别活跃的细胞破碎过程中,由于某种原因一部分mRNA与DNA、蛋白质形成了聚合体的形式.Trizol不能分离这种聚合体,从而造成了在所提取的RNA中有少量基因组DNA的污染.在这种情况下可以用无RNAse的DNAse处理,Trizol再次抽提或蛋白酶K消化后再用酸性苯酚抽提。
五:蛋白和多糖污染
离心去上清后得到的RNA沉淀经以下操作应可去除这些污染:在上一步中,每使用1ml Trizol,在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2 NaCl)。混合,离心,然后按照操作进行。这种方法可使蛋白多糖和多糖留在溶液中,而沉淀出纯RNA。从植物中提取RNA时,应在匀浆后离心,并加上以上操作步骤。