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phenol/chloroform 进行DNA 萃取

时间:2010-12-18      阅读:644

 
仪器用具:微量离心机
 
药品试剂:
Plasmid DNA 酵解产物: #1 (pBlueGus/HindIII), #2 (pBlueGus/BamHI);Phenol/chloroform/isoamyl alcohol (25:24:1) 以下简称为PCI;Chloroform/isoamyl alcohol (24:1) 以下简称为CI;3 M NaOAc (醋酸钠pH 5.2);纯酒精及70%酒精
 
方法步骤:
◆ 注意!进行这一部份实验的前,请先确定pBlueGus/HindIII 与pBlueGus/BamHI 两者的酵解反应都已经*。
1) 于酵解反应 #1 与 #2 的微量离心管分别加入182 μL 去离子水。
2) 以200 μL PCI 萃取一次,亦即加入PCI 后,以Vortex 震荡混合,并在室温离心3 min。
3) 以微量移液器P200 将上层液移至新的微量离心管。
4) 加入等体积的CI,以Vortex 充分震荡混合,并在室温离心3 min。
5) 以微量移液器P200 将上层液移至新的微量离心管。
6) 加入0.1 倍体积的3 M NaOAc (pH 5.2) 及2.5 倍体积酒精。
7) 置于 -20℃过夜,或于 -80℃放置30 min,以便沉淀DNA。
隔天:
1) 自冷冻柜取出微量离心管,以14,000 rpm 离心10 min。
􀂋 注意: 请利用这一段时间参照『基本操作技术』所描述的步骤准备一片1.2%洋菜胶体。 Ethidium bromide 是一种强力致癌物质,严禁戴着手套到处亂摸!
2) 小心地倒出上清液。
3) 徐徐加入0.5 mL的70%酒精 (预先放在 -20℃预冷)。小心不要动到DNA沈淀。
4) 以14,000 rpm 低温离心5 min 的后,倒去上清液,并将微量离心管倒置于一张干净的卫生纸上30 min,以便风干DNA。也可以用SpeedVac 干燥DNA,但应小心处理,以免DNA 沉淀不見了。
5) 以10 μL dH2O/DEPC溶解DNA。
6) 依照下表,自pBlueGus/BamHI 与pBlueGus/HindIII 各取1 μL DNA 以洋菜胶体电泳进行分析,并估算其浓度。
􀂋 DNA 浓度的估算请以 DNA/HindIII 量为参考值。

质体DNA 酵解反应与洋菜胶体电泳分析 Southern 转印分析
大肠杆菌抽取RNA 重组质体的限制酶分析
Random priming 胞外转录反应 (in vitro transcription)
以DIG 标定核酸探针 以phenol/chloroform 进DNA 萃取
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