磁体冷却系统工作原理如下：

利用电磁铁产生变化的磁场，磁场通过电磁感应作用在导体材料上，引起涡流，涡流会对导体产生电阻损耗，使其生成热量，从而将磁体系统的热量传到冷却液中，冷却液带走热量，经过热交换器排除热量，保持低温的冷却液循环流动，不断带走磁体热量，控制电磁铁的激磁电流或可以调节感应涡流，从而平稳控制磁体的温升速率，避免磁体过热损坏，保证其稳定工作，此原理应用于核磁共振及粒子对撞机等需要强磁场的设备

综上，该系统通过电磁感应和热传导原理保持磁体低温，是确保强磁场稳定的重要手段。