氮气发生器的工作原理是分离空气，电解膜的负极侧发生氧化反应，吃掉空气中的氧化性气体，在正极侧还原，空气流过电解池后就只剩下氮气和惰性气体，故国内发生器的纯度大多标有“相对含氧量”，氮气的纯度和空气流速，有效分解面的长度，电解电势的强弱都有关系，这种分离方法也决定了氮气的纯度不可能做的很高。加入电解质的作用就是提高水的导电率，使电化学反应能顺利进行。

　　发生器对色谱的影响有一点常常被忽略，就是发生器内的开关电源工作事会对电网电压造成一定的干扰(压缩机的启动和停止也会)，所以色谱仪必须经过稳压电源供电，当然不用稳压电源的用户极少。

　　对色谱来说，氮气发生器产生了氮气后，还需要脱水、脱氧(加脱水脱氧管)，否则会损害ECD检测器。

　　对质谱来说，国内的氮气发生器都无法达到很高的流量，所以，现在很多人都还使用液氮罐，来支持液质联用需要的氮气流量。

　　氮气发生器采用了高灵敏度，模糊自动跟踪控制系统，即用即产，用气产气，不用气不产气，实现了自动恒压、恒流，使压力稳定精度范围小于0.001Mpa，保证仪器输出氮气纯度高，压力稳定、安全、持续。

　　1、低温分离--由于氮气的效率提高了，化合物可在较低温度下分离，从而缩短运行时间。

　　2、可用性--通过电解水即可获得氮气，氮气发生器可按需生产氮气。

　　3、柱寿命延长--温度降低了，柱流失相应减少了，因此柱寿命也随之延长了。此外，氮气属于还原气体，可移除柱中的潜在酸性位，从而进一步延长柱的使用寿命。

　　4、速度加快--由于线性流速加快，运行时间缩短了，相应地，实验室生产量也就提高了。

　　值得提醒的一点是：氮气发生器只能在实验室内或实验室外很近的位置采集空气作为气源，而实验室内空气经常是受到污染的，其中的有机溶剂含量因为实验前处理过程等原因(此外GC的洗针溶剂挥发，液相的流动相挥发)不可避免的超标。