生物显微镜一个非常重要的问题是在取材和分离细胞过程，冰冻干燥和树脂包埋（FD）后冰冻超簿团片后，冰冻干燥后细跑各部位65元素成分含量中处理十分仔细，绝不能损伤待观察分析的细胞。因为作x线微区分析不但步骤繁多，而且成本甚高，如果经过长时间及多步骤的处理后，所分析的细胞是受损伤的细胞或死细胞，得出错误的结论是非常遗憾的。如经过胶元酶处理分离出的心肌细胞有两种形态，一种是长杆状，另一种是圆形。后者是在细胞分离过程中受损伤的濒死细胞。

　　生物显微镜这两种细胞中电解质的含量及分布十分不同。圆形心肌细胞中Na甚高而K极低，线枝体中的ca浓度十分高。经过与其它分析方法核对，证明圆形细胞高Na低K及线粒体内高ca是由于在细胞分离过程中细胞膜受损伤的结果。细胞及组织的冰凉固定方法往往是先采取淬冷固定，然后放入液氮中保存。淬冷固定对于保存的效果十分重要。活细胞或鲜组织中富含水分，当淬冷时往往是细胞或组织与碎冷剂（特别是用液氮粹冷时）直接接触的部位先冷冻固定，因而形成一个“壳”，便妨碍了细胞的中心部位碎冷固定。因此在作x一线微区分析时，常常发现较大的细胞的中心部位有冰晶存在。为了防止这种情况发生，便使用熔点比液氮高但低干一806c的物质作碎冷剂。这类物质很多，但zui易获得，价格低廉的是浓态丙烷（沸点一42．120c，熔点一187．10c，分子量44．1），冷却速度也zui快。但其缺点是易燃。