一，液相色谱法在食品分析中的应用
液相色谱法在食品分析中的应用，从80年代才开始，在国家标准《食品卫生检验方法理化部分》GB5009-85中，尚无HPLC法，到了GB/T5009-1996中才增加此法。
1 ，在乳品分析中的应用
乳及乳制品的质量评价比较复杂，包括营养成分及含量、乳品的风味物质、药物残留和毒物种类及含量等多个方面，HPLC法可用于乳品中多种质量控制指标的检测。乳及乳制品中富含糖、脂、蛋白质、维生素等营养以及强化的营养物质，HPLC技术几乎可用于各种营养成分的检测。在低分子糖类的测定中多采用氨基键合柱、糖类分析柱进行分离，也有研究者利用低成本非特定色谱柱测定低分子糖。
2，在肉制品分析中的应用
HPLC法可以测定肉制品中的兽药残留、致癌物质含量等。腌腊肉品中常添加硝酸盐或亚硝酸盐作发色剂用，由于添加量过大或自身的还原作用在肉品中生成N-亚硝胺。N-亚硝胺可诱发肝癌、结肠癌等。过去采用气相色谱法测定食物中挥发性亚硝胺，其中仅色谱测定一步便需耗时1 h之多，而采用液相色谱法则只需要13 min左右。
3 ，在其它食品分析中的应用
HPLC可以广泛地用于检测食品的农药残留，食品中过量的食品添加剂，食品中违禁成分；也可用于食品中营养成分的分析。
二，液相色谱在环境分析中的应用
由于化学工业的发展和天然化合物的开发,使得环境污染越来越严重。据报道被确认为环境污染物的已超过350种,人们能在水中、空气中、污泥里、鱼、禽体内发现这些污染物。通过食物链,它们将进一步污染肉类、蛋类、粮食、蔬菜等。环境污染的检测早已成为分析化学中重要的研究课题之一。
HPLC已在环境监测中得到广泛应用,特别适用于分子量大、挥发性低、热稳定性差的有机污染物的分离和分析如多环芳烃、酚类、多环联苯、邻苯二甲酸酯类、联苯胺类、阴离子表面活性剂有机农药、除草剂等,其中多数属于美国*（EPA）清洁水法案中颁布的114项
优先有机污染物范围。
三，液相色谱技术在药品检验中的应用
现在,在药品质量标准中,对有关物质检查的要求越来越高,一个药物从合成原料到制备有关的制剂,再经过贮备、运输、使用,要经过一段较为复杂和漫长的过程,在此期间,每一个过程都有可能产生有关的物质,如生产中可能带入原料、试剂、中间体、副产物和异构体等;在贮备和运输过程中,可能产生降解产物,聚合物等。为了保证药物的安全有效。同时也要考虑到生产的实际情况。因此,对药物的研究,可以允许有一定量的无害或低毒性的有关物质液相仪器各厂家的仪器展。还有对药品的含量测定，中药成分的检验。
四，液相色谱在生命科学中的应用
如在变性液相色谱检测法（DHPLC）在基因突变分析中的应用，DHPLC是近年来发展起来的一项相对较新的能够满足大规模基因变异检测筛查的技术。1995年,Oefner和Underhill将这项技术推荐为用于突变检测的新方法。DHPLC技术是一项在SSCP和DGGE基础上发展起来的新的杂合双链突变检测技术,其原理与DGGE类似,即通过HPLC在部分变性的条件下可将发生错配的异源杂合双链DNA和*匹配的同源双链DNA分离开来。它具有廉价省时、节约劳动力、灵敏性高、特异性强等优点。
五，液相色谱在微量元素中的应用
如对体内砷盐的检测。砷与人类的生活息息相关,是环境中存在的一种极为重要的非金属元素。由于不同形态的砷其毒性各不同,因此无论对环境样品、食品、药物还是对人体的体液进行砷的形态分析都是至关重要的。液相色谱因具有较高的分离能力而被广泛地应用于砷形态的分离研究中。随着对分析灵敏度与准确度要求的不断提高,作为砷形态分析的检测器不断发展,不同的联用技术也日益完善。其中,电感耦合等离子体质谱法以其*的灵敏度、多元素同时检测能力、极宽的动态范围以及同位素比检测能力而被成功地作为液相色谱的检测器,广泛地应用于砷的形态分析中。

总之，液相色谱分析方法不仅在分离速度、分离效能,检测灵敏度、自动化等方面具有着巨大的优势,还具有样品适用范围广（特别对热不稳定物,难气化的样品）等优点。因此它已在仪器分析法中占有愈发重要的地位,是药品质量控制的关键技术之一。