Echo如何以快速、精|准、任意孔到任意孔移液加快细胞株开发
时间:2020-11-17 阅读:1920
细胞株构建是生物学常用的工具之一,也是很多项目的关键步骤,构建一个好的细胞株也就成功了一半。但目前我们可能更多关注的是下游的细胞实验,例如获得的构建好的质粒转染、富集、筛选、优化及放大等等。而且已经有很成熟的自动化设备来帮助我们进行相应的液体操作,包括贝克曼也有全套的自动化解决方案。但这些前提都是我们获得了一个优质的质粒。如果不是呢?
那我们该如何快速又系统的设计我们想要的细胞株呢?如何提高细胞株效能,降低风险?有如何利用有限的资源更快的做更多的测试?
基因-蛋白-细胞,系统化设计
非常幸运的是,分子生物学和生物信息学技术的发展,给了我们从基因、蛋白、细胞层面等系统设计的可能,各种新的思路和新的技术,如基因组装、基因编辑、PCR、NGS测序技术和TXTL无细胞表达系统等技术可以帮助我们开展测试。
Echo微量化,显著降低成本,让新技术更经济
系统化的设计必然会带来更大的样本量,从而导致更高的费用,这也是大家对新技术和多因素考虑一个望而却步的原因。Echo采用声波的能量进行无接触式移液,且每滴液滴仅为2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸头耗材的消耗,也可以将检测反应体系降低5-100倍,使成本急剧下降。
Echo快速任意孔到任意孔移液,加快组装,使结果更一致
在基因组装中将不同的DNA|片段混合,在检测反应中将不同的成本组合,在NGS文库构建过程中将多个文库pooling到一起,在CRISPr基因编辑中构建sgRNA文库等等,都需要进行快速、变化体积、灵活加样,这也是传统移液工作站很难突破的一点,往往也要1小时甚至几小时才能完成。声波移液技术Echo的任意孔到任意孔的快速移液特点则让此类应用简单、快速化,仅需几分钟即可,大大优化工作流。
Echo加样精|准,提高克隆效率
使用Echo进行微量化DNA组装,可以在构建更低的情况下获得更高的转化效率。在Gibson组装中,反应体系500nL和1000nL时转化效率不差于手工操作20uL,反应体系降低40倍;在Golden Gate组装中,表现更优|秀,反应体系低至50nL时转化效率就不差于手动操作7.5uL,反应体系可降低150倍。
Echo以微量化、纳升精|准化、快速任意孔到任意孔移液,加快细胞株开发
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Reference:
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology. Kanigowska et al. Journal of Laboratory Automation 1–8, 2015.
*以上涉及产品仅用于科研和工业,不用于诊断