微生物环境监测是测量代表环境质量的各种指标数据的过程，它包括环境分析，物理测量和生物监测。所谓的生物监测是利用生物体对环境污染的各种信息作为判断环境污染的一种手段。生物在自然界中长期生存，不仅可以反映多因素污染的综合影响，还可以反映环境污染的历史条件。因此，生物监测可以弥补理化分析和测试的不足。特别地，微生物具有*的特征并且与环境密切相关。因此，微生物学方法在生物学监测中占有特殊的地位。

　　1、微生物环境监测粪便污染指示剂细菌

　　粪便污染指示剂细菌的存在是水体中粪便污染的指示剂。根据对正常人粪便中微生物的分析和测量结果，认为以大肠菌和粪链球菌为指标更合适，前者使用更广泛。

　　大肠菌群是指与大肠杆菌相似的一大类需氧和兼性厌氧革兰氏阴性非细菌细菌。它们可以在48小时内发酵乳糖以产生酸和气体，包括大肠杆菌，柠檬酸杆菌，肠杆菌，克雷伯菌等。确定大肠菌的常用方法有两种：发酵法和膜滤法。

　　有两种表达大肠菌群数量的方法。一种是“大肠菌数量”，也称为“大肠菌指数”，即1升水中所含大肠菌的数量。第二个是“大肠菌群值”，是指可以检测到水样中的1种大肠菌群的小水样体积（mL）。值越大，水中的大肠菌数量越少。

　　我国的饮用水卫生标准规定，每1升水中的大肠菌群总数不得超过3个，即大肠菌群的含量不得少于333mL。

　　2、微生物环境监测水污染指标生物区

　　普通生物更适合用于清洁水体，但有些生物适合于一定程度的污染水体。在具有不同污染水平的各种水体中，每个都有其自身的生物种类和组成。根据水域中动植物的微生物区系，可以推断水域的污染状况，并通过上述检测确定污水生物区。水体通常分为多个污染区，中等污染区和低污染区。中型脏污带分为A型中型脏污带和B型中型脏污带。