口腔/咽拭子基因组DNA快速提取操作步骤
时间:2021-03-10 阅读:7211
口腔/咽拭子基因组DNA快速提取试剂盒
Rapid Swab DNA Kit
保存条件:本试剂盒在室温储存 12 个月不影响使用效果. 蛋白酶 K 可室温运输,建议-20℃长期保存。
产品介绍:
本试剂盒采用特制的进口DNA 吸附柱和*的缓冲液系统,特别适合于从口腔咽拭子中分离纯化基因
组DNA。各种来源样品裂解消化处理后 DNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜(特
别配备了 Carrier RNA 可以从体系中轻松捕获微量核酸),再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、
细胞代谢物、蛋白等杂质去除,后低盐的洗脱缓冲液将纯净的基因组 DNA 从硅基质膜上洗脱。纯化后的
DNA 无杂质和 PCR 抑制剂,可直接适用于PCR 分析。
产品特点:
- 配备了 Carrier RNA 用于充分收集特别微量DNA。
- 提取的 DNA 纯度高,质量稳定可靠,可适用于各种常规操作,包括 PCR、酶切、测序、Southern 杂交等。
注意事项:
1. 结合液 CB 或者抑制物去除液 IR 低温时可能出现析出和沉淀,可以在 37℃水浴几分
钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2. 避免试剂长时间暴露于空气中发生挥发、氧化、pH 值变化。
3. Carrier RNA
1) Carrier RNA 使用方法:如果起始处理量很少(口腔咽拭子上收集到的细胞很少),我们推荐使用 Carrier RNA,如果预期有较大量 DNA 产量,用户可以根据需要选择是否加入 Carrier RNA。使用时每个样品提取所需结合液 CB 中加入 1μl Carrier
RNA 储存溶液, 将结合液 CB 与 Carrier RNA 溶液充分颠倒混匀即可(结合液 CB 容易起泡沫,请勿使用涡旋振荡混匀)。也可根据样品数量,在总共需要的结合液CB 中加入总共需要的 Carrier RNA 混匀备用。混合液在室温 24 小时内稳定。
- Carrier RNA 加入过多造成 DNA 洗脱液中 Carrier RNA 浓度过高,下游 PCR 反应可能受干扰,加入过少可能并不能帮助提高 DNA 产量和 PCR 敏感度,因此加入量应该在具体试验中调整以得到-*佳效果。
自备试剂:无水乙醇
操作步骤:
提示:第-*次使用前请先在15ml 漂洗液 WB 中加入 60ml 无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框
打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
取样:取一根医用消毒棉签(手不要碰触脱脂棉部位),伸进口腔,紧靠脸颊内侧来回刮拭20 次(不
时旋转棉棒),需充分接触口腔粘膜。
注意事项:避免用手触及棉签,采集前可先用清水轻轻漱口。为防止样本被食物或者饮料污染,取样前
30 min 内应该避免进食或者饮水。
1. 用剪刀将棉签部分从其杆上剪下,放入2ml 离心管中,加入400μl 裂解液 ML。
2. 再加入 20μl 的蛋白酶 K (20mg/ml)溶液,立刻涡旋振荡充分混匀,56℃放置 30 min,期间每 10 min 涡
旋混匀 10 sec。
3. 加入 400μl 结合液 CB,立刻涡旋振荡充分混匀,70℃放置 10 min(挤压去除拭子, 将尽可能多的裂
解液转移至新的离心管中)。
如果拭子上细胞数量少,导致提取的基因组 DNA 产量过低, 可以在400μl 结合液CB中加入 1μl Carrier RNA 储存溶液。
4. 冷却后加 200μl 无水乙醇,立刻涡旋振荡充分混匀。简短离心以除去管盖内壁的液滴,收集所有的液体
到管底。(如果周围环境高于 25℃,乙醇需要冰上预冷后再加入)
5. 将上一步混合物中加入一个吸附柱AC 中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm 离心30-60 sec,倒掉收
集管中的废液。
6. 加入500μl 抑制物去除液IR,12,000rpm 离心 30 sec,弃废液。
7. 加入500μl 漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30 sec,弃掉废液。
8. 重复操作步骤 7。
9. 将吸附柱 AC 放回空收集管中,12,000rpm 离心2min,将吸附柱置于室温放置数分钟,以*晾干吸附
材料中残余的漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
10. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加 20-50μl 洗脱缓冲液 EB (洗脱缓
冲液事先在65-70℃水浴中预热效果更好), 室温放置 1 min,12,000rpm 离心 1 min。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置1 min,12,000rpm 离心1 min。
洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA 浓度较高,可以适当减少洗脱体积, 但是小体积不应少于 20μl,体积过小降低DNA 洗脱效率,减少DNA 产量。(注意:DNA 产物应保存在-20℃,以防 DNA 降解)
DNA 浓度及纯度检测
得到的基因组DNA** 片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。回收 得到的DNA** 片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。
DNA 应在 OD260 处有显著吸收峰,OD260 值为 1 相当于大约50μg/ml 双链DNA、
40μg/ml 单链 DNA。OD260/OD280 比值应为 1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用灭菌水比值会偏低,因为 pH 值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
本产品仅供科研不用于临床诊断
实验代做服务:
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