利用多管发酵法使用生化培养箱培育物质在实验之前必须要有所准备，比如采集样品、调节温度、水样体积的计算等都要做出预计，以及培育过后的保存都要注意。多管发酵法所使用的培养液在分装于各发酵管中后，应将发酵管尽快放于生化培养箱中，在115℃灭菌20min，这个温度也应控制好，既达到灭菌的作用，还要防止培养物质分解流失，然后贮存于冰箱或暗处备用。

滤膜法所采用的M-FC培养基多使用外购的成品，培养基中苯胺蓝的纯度和质量往往影响菌落的颜色，因此，无菌包装的成套培养基在使用前，先接种典型粪大肠菌，以观察对比菌落的颜色，来鉴定其稳定性。

生化培养箱多管发酵法的结果是根据不同接种量的发酵管所出现阳性结果的数目，从MPN表中查得相应的MPN指数，来计算每升水中粪大肠菌群细菌的MPN值。MPN是指zui大可能数，它是根据统计学理论，估计水体中的菌群密度和卫生质量的一种方法，所以准确判断不同接种量发酵管的阳性数是非常重要的，否则将导致较大偏差。滤膜法的结果是计数滤膜上呈蓝或蓝绿色的菌落，来计算出每升水样中的粪大肠菌群数。所以为便于计数，减少误差，理想的水样体积是一片滤膜上生长20-60个粪大肠菌群菌落。