荧光染料可对蛋白质、核酸和聚糖等其他结构进行染色，即便钙离子等非生物物质也可以检测出来。利用荧光物质与相应抗体或抗原发生特异性结合后，可对待测物进行定位、定性和定量的分析，此方法具有度特异性、性和直观性，是早出现的标记技术。

当荧光物质吸收激发光的能量后，电子从基态跃迁到激发态，当其回复至基态时，以发射光形式释放出能量，称为荧光。其特点为在接受能量后即可引起发光，而一旦停止供能后，荧光随之瞬间消失。

荧光标记

核酸、蛋白、血清、过氧化物、HRP;辣根过氧化物、α-淀粉、β-葡聚糖、菠萝蛋白、辅A、果胶、麦芽糖（麦芽提取）、尿素,脲(巨豆)、纤维素、蜗牛、乙酰酯(ACE)、脂肪、中性蛋白、胰凝乳蛋白原 A、胰蛋白、透明质酸、木聚糖、溶菌(蛋清)、消化、淀粉、α-淀粉、α-糜蛋白、α类固醇脱氢、β-葡聚糖、丁酰酯、乙醇脱氢（ADH）、凝血、单宁、尿酸、己糖激、普鲁兰、木瓜蛋白、木聚糖、氯化溶菌晶体、溶葡球菌、甘油激、磷酸肌酸激、纤维素、肌酐、胃蛋白(猪源)、胆红素氧化、胰、脂肪、葡聚糖、蛋白K、谷氨酸脱氢、透明质酸、链霉蛋白E、激、磷酸、肽。

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