中国医药生物技术协会生物样本库标准(试行)
时间:2020-01-04 阅读:5423
中国医药生物技术协会生物样本库标准(试行)
编者按
医学标准化、高质量的生物样本库是重大疾病(尤其肿瘤)基础与临床研究、临床诊治技术研发、药物研发、健康(预测预防)研究与产业化,即实现转化医学的宝贵资源、重要环节之一,毫无疑问也是当今生命科学原创性研究、生物医药产业自主创新体系中至关重要的环节与保证。2009 年 9 月美国国家癌症研究所(NCI)开始筹划建立美国diyi个guojia肿瘤生物样本库,Times 更是将这个国家生物样本库列为“2009 年改变世界规划”之八。我国疾病样本资源极其丰富,是任何一个国家所*的,我们必须抢占重大疾病生物样本库建设先机,以抢占我国在生命科学研究与生物医药产业领域制高点。
然而,目前我国医院生物样本库建设尚处于初创阶段,存在无序、分散、闭、缺乏标准化流程、缺乏质控体系与信息化管理、临床资料残缺不全(尤其治疗与随访资料)、伦理学与法律不健全等问题,严重降低了我国生命科学研究水平、阻碍了创新性新药研发与临床诊治技术开发进程。中国医药生物技术协会生物样本库分会于2010 年组织全国范围内的组织生物样本库建设现状调研发现,我国各相关大学、研究院所与医院都非常重视生物样本库的建立与转化医学的研究,建设单位都急盼行业与国家标准的出台。
为此,中国医药生物技术协会生物样本库分会组织国内基础、临床、病理、建库技术、法律等领域 20 位专家,共同编制了中国医药生物技术协会《生物样本库》的标准。该标准分为两个部分:第 1 部分:生物样本库
设施与保障;第 2 部分:肿瘤生物样本操作规程。该标准虽经专家们反复讨论、修改,想必在全国范围内实施过程中,一定还会存在问题,希望同道们能及时反馈,以利于进一步修改、完善。
第 1 部分:生物样本库设施与保障
1 范围
本部分规定了生物样本库相关的术语、环境、设备和保障。
本部分适用于生物样本库的建设。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是*的。凡是注日期
的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期
的引用文件,其zuixin版本(包括所有的修改单)适用于本文
件。
GB 50052-2009 供配电系统设计规范
GB 19489-2008 实验室生物安全通用要求
GB/T 18883-2002 室内空气质量标准
GB/T 20269-2006 信息安全技术信息系统安全管理要
求
AQ3013-2008 危险化学品从业单位安全标准化通用规
范
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1 生物样本
任何包含人体生物信息的生物物质,包括人体组织、血
液、分泌物、排泄物及其衍生物。
3.2 生物样本库
规范化收集、保存和处置离体生物样本的机构,为人类
健康、疾病诊断与药物研发等生物医学研究提供资源。
3.3 新鲜样本
离体的、未经处理的生物样本。
3.4 冷冻样本
保存于 –40 ℃ 以下环境中的生物样本。
3.5 石蜡样本
经过中性福尔马林等适宜的固定液固定、脱水、石蜡包
埋处理所保存的生物样本。
3.6 生物样本库信息管理系统
记录生物样本库所保存的生物样本及其相关临床、病
理、随访、伦理审查及知情同意等信息的应用软件及硬件。
3.7 样本捐赠者
捐赠个体生物样本以用于生物医学研究的自然人,简称
捐赠者。
3.8 知情同意书
捐赠者或其法定监护人表示自愿捐赠个体生物样本而
签署的文件。
4 生物样本库的规模
根据样本储存容量,生物样本库的规模分为四个级别,
即:小型生物样本库、中型生物样本库、大型生物样本库和
超大型生物样本库。详见表 1。
表 1 生物样本库的规模
序号 样本库规模 保存环境 样本容量(万份) 存储空间(m 2 )
深低温 < 5
超低温 < 10
1 小型
常温 < 15
< 100
深低温 5 ~ 15
超低温 10 ~ 30
2 中型
常温 15 ~ 45
100 ~ 300
深低温 15 ~ 30
超低温 30 ~ 60
3 大型
常温 45 ~ 90
300 ~ 600
深低温 > 30
超低温 > 60
4 超大型
常温 > 90
> 600
5 生物样本库功能区域及主要设备
5.1 生物样本存储区的主要设备
5.1.1 石蜡样本/切片存储区的主要设备
a) 石蜡样本柜
b) 切片柜
5.1.2 冷冻样本存储区的主要设备
5.1.2.1 无热源区
a) 液氮罐/柜
b) 液氮供应罐
5.1.2.2 有热源区
a) 普通低温冰箱(–40 ℃)
b) 超低温冰箱(–86 ℃)
c) 深低温冰箱(–135 ~ 150 ℃)
5.2 生物样本处理区的主要设备
5.2.1 组织样本处理区的主要设备
5.2.1.1 样本临时存放设备
a) 冷藏柜
b) 普通液氮罐
c) 生物样本低温转运设备
5.2.1.2 样本取材设备
a) 取材台
b) 组织取材器具
5.2.1.3 样本记录设备
a) 数码照相机
b) 标签打印机
c) 生物样本库信息管理系统终端
5.2.1.4 样本脱水设备
组织脱水机
5.2.1.5 样本包埋设备
组织包埋机
5.2.1.6 样本制片设备
a) 冰冻切片机
b) 石蜡切片机
c) 捞片机
d) 烤片设备
5.2.1.7 切片染片设备
组织切片 HE 染色机
5.2.1.8 切片封片设备
HE 染色切片封片机
5.2.2 血液-体液及其他样本处理室
a) 水平离心机
b) 电子秤
c) 移液器
d) 冷冻标签打印机
e) 生物样本库信息管理系统终端
6 职能机构
6.1 科研管理机构
科研管理机构负责以下工作:
a) 生物样本库建设的计划、目标与预算的拟定;
b) 生物样本库建设的组织协调。
6.2 科学技术管理委员会
a) 委员会应由生物医学领域的专家组成;
b) 主要负责生物样本采集与使用的科学审查。
6.3 伦理委员会
6.3.1 组成
a) 伦理委员会应从生物医学领域和管理学、法学、社
会学等领域的专家中推举产生,人数不得少于 5 人,其中
至少有 1 名医学专业委员,至少有 1 名非医学专业委员,
至少有 1 名非本单位委员,并且应当有不同性别的委员;
b) 少数民族地区应考虑少数民族委员;
c) 伦理委员会委员任期 5 年,可以连任;
d) 伦理委员会设主任委员 1 名,副主任委员若干名,
由伦理委员会委员协商推举产生,可以连任。
6.3.2 权利
a) 对本机构及其所属机构的生物样本收集、使用及处
置进行伦理审查、监督和检查;
b) 按照伦理原则不受任何干扰地自主作出决定。
6.3.3 义务
a) 组织开展相关伦理培训;
b) 为接受伦理审查的方案保密;
c) 审查结果应当及时传达或者发布。
6.4 样本库执行机构
样本库执行机构负责以下工作:
a) 在伦理委员会和科研管理机构许可范围内进行样
本的收集;
b) 按照规定流程收集、运输、储存与管理样本;
c) 根据科研管理机构的审批进行样本出库。
7 人员配备与资质
生物样本库应配备专业技术人员。生物样本库负责人应
为医学相关专业的人员。
每个岗位的专业技术人员应该经过中国医药生物技术
协会组织生物样本库分会的专业培训,并考核合格。
8 伦理准则
a) 采集和使用人类生物样本应建立在保护人的生命
和健康,维护人的尊严的基础上;
b) 对捐赠者的安全、健康和权益的考虑必须高于对科
学和社会利益的考虑,力求使捐赠者受益和尽可能
避免伤害;
c) 尊重和保护捐赠者的隐私,如实将涉及捐赠者隐私
的资料储存和使用目地及保密措施告知捐赠者,不得将涉及
捐赠者隐私的资料和情况向无关的第三者或者传播媒体透
露;
d) 一般情况下,履行知情同意程序,尊重和保障捐赠
者自主决定同意捐赠与否,不得使用欺骗、利诱、胁迫等不
正当手段使捐赠者作出错误的意思表示;
e) 对于丧失或者缺乏能力维护自身权利和利益的捐
赠者(弱势人群),包括儿童、孕妇、智力低下者、精神病
患者、囚犯以及经济条件差和文化程度很低者,应当予以特
别保护。
9 安全保障
9.1 实验室安全
a) 对于生物样本库内有使用到有毒、有害物质的工作
区域,应遵守危险化学品从业单位安全标准化通用规范
(AQ3013-2008)。
b) 所有生物样本都被视为具有生物危害风险,样本库
建立应采取生物安全预防措施,遵守实验室生物安全通用要
求(GB 19489-2008)。
9.2 样本安全
9.2.1 环境维护
a) 消防安全。生物样本库必须配置消防给水系统和无
水阻燃剂灭火器,并定期进行消防设施检修和维护。
b) 供电保障。生物样本库应配备双路市电供电及配置
备用电源,并遵循供配电系统设计规范(GB 50052-2009)。
c) 空间要求。生物样本存储区需有足够的空间且通风
良好。
d) 室温控制。根据室内空气质量标准(GB/T 18883-
2002),生物样本库室内温度须控制在 16 ~ 28 ℃ 水平。
e) 湿度控制。根据室内空气质量标准(GB/T 18883-
2002),生物样本库相对湿度需控制在 30% ~ 80%。
f) 紫外消毒。生物样本库须安装紫外线消毒设施,定
期对生物样本库各功能区域进行消毒处理。
9.2.2 硬件设施
a) 设备安全。仪器设备须根据厂商要求定期维护和更
换。
b) 远程报警。生物样本库的超低温或深低温存储设
备,必须安装自动远程监控报警系统。
9.2.3 管理机制
a) 准入权限。样本存储区域应建立人员出入管理机
制,仅允许授权人员进入。
b) 应急预案。生物样本库管理应建立应急预案。
9.2.4 信息安全
a) 遵循信息安全技术信息系统安全管理要求(GB/T
20269-2006),生物样本库信息系统应进行权限设置,工作
人员只能按照授权进行操作,操作记录应保留供查询。
b) 定期对保存生物样本库数据信息的服务器进行维
护。
c) 定期对保存于服务器上的数据信息进行备份。
10 质量控制
对不同类型的样本设定相应的质量控制管理体系;
质量管理人员直接向样本库负责人报告;
第 2 部分:肿瘤生物样本操作规程
1 范围
本部分规定肿瘤生物样本库相关的术语和操作规程。
本部分适用于肿瘤生物样本的采集、处理和保存。
本部分应与中国医药生物技术行业标准的第 1 部分配
套使用。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是*的。凡是注日期
的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期
的引用文件,其zuixin版本(包括所有的修改单)适用于本文
件。
NIPCGR-DCI-03 中国人类遗传资源特性信息描述规范
(中国人类遗传资源平台)
ISBN 7801941950 临床技术操作规范 · 病理学分册
(中华医学会)
ISBN 7564105836 全国临床检验操作规程(第三版) (中
华人民共和国卫生部医政司)
3 术语和定义
第 1 部分界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1 样本采集者
为生命科学研究而采集、保存生物样本的机构或个人,
简称采集者。
3.2 正常组织
位于同一器官、病理诊断为正常或一般炎症的组织。
3.3 肿瘤旁组织
位于同一器官、病理诊断明确不含肿瘤细胞的炎症或肿
瘤前病变组织。
3.4 肿瘤组织
位于肿瘤病灶部位的组织
3.5 常温保存
将样本保存于 16 ~ 28 ℃。
3.6 冷藏保存
将样本保存于普通冷藏设备中,保存温度为 2 ~ 8 ℃。
3.7 冷冻保存
将样本保存于低温存储设备中。根据低温程度的不同,
分为普通低温冷冻保存(–40 ℃ 低温设备)、超低温冷冻保
存(–86 ℃ 低温设备)、深低温冷冻保存(–135 ℃ 以下低
温设备)。
4 生物样本编码
4.1 相关代码
4.1.1 样本采集单位代码
见全国组织机构代码。
4.1.2 手术器官代码
见《人体器官代码表》(附录 A)
4.1.3 样本类型代码
见《生物样本类型代码表》(附录 B)
4.1.4 组织样本取材部位代码
a) 正常组织用“N”表示;
b) 肿瘤旁组织用“P”表示;
c) 肿瘤组织用“T”表示;
d) 淋巴结用“L”表示。
4.2 样本编码规则
a) 组织样本编码:由手术器官代码(A)、器官内流水
号(B)、样本类型代码(C)、取材部位代码(D)、样本管/
块/份编号(E)五部分组成。具体编码格式如下:ABCDE。
举例:D09A00001B20T1。D09 表示胃,A00001 表示
胃的流水号,B20 表示冻存组织样本,T 表示肿瘤组织,
1 表示第 1 管份。
b) 血液、体液、人体排泄物样本编码:由手术器官代
码(A)、器官内流水号(B)、样本类型代码(C)、样本管
份编号(D)四部分组成。具体编码格式如下:ABCD。
举例:D09A00001C201。D09 表示胃,A00001 表示胃
的流水号,C20 表示血清样本,1 表示第 1 管份。
4.3 样本存放位置编码
a) 常温存储设备(石蜡柜和切片柜)样本存放位置采
用三级编码:样本柜号、样本盒号、样本盒内位置编号。三
级编码之间用“-”连接。
b) 冷冻存储设备(液氮罐/柜和超低温冰箱)样本存
放位置采用四级编码:设备编号、冻存钢架编号、冻存盒号、
冻存盒内位置编号。四级编码之间用“-”连接。
5 样本标签
5.1 石蜡样本标签
石蜡样本标签包含两部分:
a)样本识别信息标签,包含样本采集单位代码和组织
样本编码,粘贴于石蜡样本的正面;
b)样本存放位置标签,粘贴于石蜡样本的侧面。
5.2 切片标签
切片标签包含:样本采集单位代码、组织样本编码、切
片存放位置信息。切片标签信息直接打印或粘贴于载玻片的
标签标记区域。
5.3 冷冻组织样本标签
冷冻组织样本标签包含:样本采集单位代码、组织样本
编码、样本存放位置信息。样本标签粘贴于冻存管管壁的标
签标记区域。
5.4 血液、体液、排泄物等样本标签
血液、体液、排泄物等样本标签包含三部分:
a)样本识别信息,包含样本采集单位代码和组织样本
编码;
b)样本采集时间;
c)样本存放位置信息。
对于抗凝血样本,必须注明抗凝剂名称。样本标签粘贴
于冻存管管壁的标签标记区域。
6 操作规程
6.1 样本采集审查
6.1.1 采集申请
生物样本库负责人,应向科学技术管理委员会与伦理委
员会提交样本收集方案。
6.1.2 审查形式
科学技术管理委员会审查通过后,伦理委员会召开会
议,审阅讨论该申请。伦理委员会对审查意见应在讨论后以
投票方式作出决定。伦理委员会应建立工作程序,所有会议
及其决议均应有书面记录,签发书面意见。
6.1.3 审查要点
伦理委员会对申请伦理审查的项目进行下列审查:
a) 人员、设备条件是否符合要求;
b) 是否符合伦理原则的要求;
c) 捐赠者可能遭受的风险程度及保护措施;
d) 在办理知情同意过程中,向捐赠者(或其家属、监
护人、法定代理人)提供的有关信息资料是否完整易懂,获
得知情同意的方法是否适当;
e) 对捐赠者的资料是否采取了保密措施。
6.1.4 决议标准
伦理委员会做出的决定至少应当得到伦理委员会三分
之二委员同意。伦理委员会的决定应当说明理由。
6.1.5 审查决议
a) 同意;
b) 修正后再审查;
c) 不同意;
d) 暂停或终止。
6.1.6 伦理委员会审查意见书
a) 生物样本的采集方案需伦理委员会审查批准并签
署《伦理委员会审查意见书》,方可准予立项。
b) 人类生物样本的收集未获得伦理委员会审查批准
的,不得开展工作。
c) 当实施程序或者条件发生变化时,必须重新向伦理
委员会提出伦理审查申请。
6.2 知情同意
应当在充分告知、尊重捐赠者权利的前提下签署知情同
意书,且至少应当载明以下条款:
a) 捐赠样本的种类、来源以及采集方式;
b) 捐赠样本的保存、用途和目的;
c) 捐赠者可能遭受的安全、健康和权益的风险,以及
相应保护措施;
d) 涉及捐赠者相关信息的收集、储存和使用,以及相
应的保密措施;
e) 尊重和保障捐赠者自主决定并行使无偿捐赠的权
利。
6.3 样本采集与保存
6.3.1 组织样本采集与保存
6.3.1.1 首要原则
组织样本取材不能影响常规临床病理诊断,并遵循临床
技术操作规范(病理学分册,ISBN 7801941950)。
6.3.1.2 组织样本采集时限
组织样本采集必须在手术标本离体后 30 min 内完成。
6.3.1.3 手术标本清洁
先后用流水及预冷生理盐水快速将手术标本表面/腔面
的血液、黏液以及污物冲洗干净。
6.3.1.4 手术标本描述
遵 循 临 床 技 术 操 作 规 范 ( 病 理 学 分 册 , ISBN
7801941950),对于送检手术标本的系统性描述和记录。
6.3.1.5 手术标本拍照
a) 按照人体器官组织正常的解剖摆放位置摆放手术
标本,放置直尺予以标记标本尺寸,拍摄手术标本全景照片。
b) 根据手术标本的具体情况及临床病理学特征,从不
同视角进行多张图片拍照。
6.3.1.6 组织样本取材
遵循距离肿瘤病灶中心由远及近的原则,先后采集正常
组织、肿瘤旁组织、肿瘤组织样本。所采集组织样本根据实
际大小再行分切,每块组织大小一般不超过 1 cm 3 × 1 cm 3 ×
0.4 cm 3 。
6.3.1.7 组织样本保存
a) 新鲜组织样本冷藏保存不超过 4 h。
b) 冷冻组织样本放入液氮内速冻后深低温冷冻保存。
c) 石蜡组织样本常温保存。
6.3.2 血液样本采集与保存
6.3.2.1 血液样本采集时间选择
一般选择在治疗前采集捐赠者的空腹外周静脉血。根据
研究的需要,也可采集捐赠者治疗过程中和治疗后的空腹外
周静脉血。
6.3.2.2 血液样本采集
遵 循 全 国 临 床 检 验 操 作 规 程 ( 第 三 版 , ISBN
7564105836),分别用真空采血管(抗凝管和促凝管)采集
捐赠者血液样本。根据研究的目的选择不同的抗凝剂。
6.3.2.3 血液样本处理
遵 循 全 国 临 床 检 验 操 作 规 程 ( 第 三 版 , ISBN
7564105836),从所采集的全血样本中分离出血浆或血清。
血浆、分离血浆后的剩余全血、血清、凝xuekuai,均予以每管
200 ~ 500 μl 分装。
6.3.2.4 血液样本保存
新鲜血液样本冷藏保存不超过 12 h。
冷冻血液样本超低温或深低温冷冻保存。
6.3.3 其他样本采集与保存
其他样本的采集,应遵循全国临床检验操作规程(第三
版,ISBN 7564105836)。样本采集后,遵循无菌原则及时分
装,超低温或深低温冷冻保存。
6.4 资料采集与管理
6.4.1 资料采集
样本相关的资料信息包括捐赠者的知情同意书、病历资
料和随访资料。
6.4.2 资料保存
a) 生物样本的电子资料和纸质文档应同时保存。
b) 电子资料信息保存于生物样本库信息管理系统。纸
质文档由样本库统一保管。
c) 入库生物样本必须配备知情同意书原件。
6.5 样本使用
6.5.1 使用申请
研究者必须如实填写并递交生物样本使用申请及研究
方案的摘要,送交科学技术管理委员会。
6.5.2 科学审查
科学技术管理委员会对样本申请及研究方案进行科学
审查,判定是否可以调用所申请的样本。如果有需要修正的,
须提出修正意见。研究者根据修改意见重新填写生物样本使
用申请。委员会专家对与自身利益相关项目应采取回避机
制。
6.5.3 伦理审查
a) 伦理委员会对通过科学审查的样本使用申请进行
伦理审查。
b) 生物样本使用时,须向伦理委员会提交免知情同意
申请。
6.5.3.1 审查要点
伦理委员会对申请伦理审查的项目进行下列审查:
a) 项目的人员配备、经验及设备条件是否符合要求;
b) 项目是否符合伦理原则的要求;
c) 对捐赠者的资料是否采取了保密措施;
d) 研究人员与捐赠者之间有无利益冲突;
e) 对项目提出的修正意见是否可接受。
6.5.3.2 审查程序
见本部分 6.1.2,6.1.4,6.1.5。
6.5.3.3 伦理委员会审查意见书
a) 生物样本的应用方案需经伦理委员会审查批准并
签署《伦理委员会审查意见书》(附录 C),方可准予立项。
b) 人类生物样本的应用未获得伦理委员会审查批准
的,不得开展工作。
c) 当实施程序或者条件发生变化时,必须重新向伦理
委员会提出伦理审查申请。
6.5.4 样本出库
a) 审查通过的样本申请,生物样本库方可准予办理样
本和相关资料出库。
b) 申请者与生物样本库共同签署样本使用协议后执
行样本出库。
c) 样本出库信息记录到生物样本库信息管理系统。
d) 在向样本使用者提供相关资料信息时,必须隐藏掉
任何可识别捐赠者个人身份的信息。
6.6 样本运输
6.6.1 安全规定
所有生物样本都被视为具有生物危害风险,样本的包装
和运输应严格遵循国家的相关规定[高致病性病原微生物菌
(毒)种或样本运输管理规定],委托有资质的运输公司进
行运输,确保样本安全和运输人员的安全。生物样本的运输
应该遵循以下规则:
a) 如实申报运输样本以及制冷剂的内容和潜在的危
险性;
b) 必须单独包装,不得以夹带或其他方式混装在普通
运送包裹中。
6.6.2 温度保障
石蜡样本常温条件运输;冷藏样本需要用足够的冰块或
冰袋将样本温度维持在 2 ~ 8 ℃;低温保存的样本需要在干
冰或液氮的保护下进行运输。运输过程中应当始终保障制冷
剂足量并*覆盖样本。不同温度条件的样本在运输过程中
不得混合,应该分成独立的包裹进行运输。
6.6.3 生物样本运输的其他要求
6.6.3.1 生物样本运输必须由寄送方准备运送清单,以便
于收件方核对。
6.6.3.2 生物样本运输应该用合适的包装以免造成样本的
破碎或者其他损失。
6.6.3.3 收件方在核实样本后必须对样本的物理状况进行
核对,然后回复寄送方。如有任何遗漏或者损失,应当及时
提出。
6.7 样本销毁
生物样本库应建立无效或过期样本销毁制度,销毁制度
应当严格依照相关法律法规进行销毁。
7 附录
志谢 牵头起草单位与专家:上海芯超生物科技有限公
司、生物芯片上海国家工程研究中心(郜恒骏、张可浩、张
小燕、张宝峰、方静、何逖、姚海嵩);参与起草单位与专
家:北京协和医院(陈杰、卢朝辉);北京大学人民医院(刘
玉兰、张育军);北京大学肿瘤医院(吕有勇);复旦大学附
属中山医院(樊嘉、邱双健);第二军医大学附属长海医院
(朱明华);复旦大学附属肿瘤医院(杜祥);第四军医大学
附属西京医院(吴开春、郭长存);中山大学附属肿瘤医院
(贾卫华)与海尔集团公司(刘占杰)。吕有勇教授还代表
国家 863 胃癌分子分型与肿瘤基因组重大项目组参加该标
准的起草。