DNA实验技术:区域特异性诱变实验
时间:2013-08-02 阅读:1311
可在长达3‘的克隆化DN段上产生大量的随机分布的核苷酸替换突变,在将DNA克隆到一个可用来分离单链DNA的载体后,用各种可造成特定碱基损伤的化学试剂处理。
实验方法
- 基本方案
实验材料 | DNA |
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试剂、试剂盒 | 乙酸钠 亚硝酸钠 TE 无水乙醇 dNTP 反转录酶 RNA酶 洗脱液 溴化乙锭 |
仪器、耗材 | 水浴锅 培养箱 |
实验步骤 | 1. 用限制性内切核酸酶消化DNA以获得目的DN段,将靶片段双向克隆到M13噬菌体载体或含有M13复制起始子的质粒载体中。从100 ml 感染细抱培养物中提取单链DNA。 2. 在三个微量离心管内各加入40 μg 1 mg/ml 的单链DNA,如果靶序列的两条链都要被利用,则需用6个反应。 3. 亚硝酸反应:在一个管内加入10 μl pH4.3的2.5 mol/l 乙酸钠和50 μl 2 mol/l 亚硝酸钠,混匀,室温温育60 min。 4. 甲酸反应:在另一管内加60 μl 浓甲酸,混匀,室温温育10 min。 5. 肼反应:在第三个管内加60 μl 浓肼,混匀,室温温育10 min。 6. 毎管加100 μl 2.5 mol/l pH5.5的乙酸钠,30 μg 担体tRNA和1 ml 无水乙醇,置干冰中冻至-80℃,放置10 min,离心10 min,去上清,重复乙醇沉淀两次,再用80 μl TE缓冲液重悬DNA。 7. 在重悬的DNA内加10 μl 4种dNTP混合液,10 μl 10×反转录酶缓沖液和100 pmol 的寡核苷酸引物。先在85 ℃温育5 min,再于40℃温育15 min。 8. 加10 μl 4种dNTP混合液和30~40 U 的AMV反转录酶,37℃温育1 h。 9. 用缓冲液平衡酚抽提和乙醇沉淀DNA,DNA重悬于100 μl 10×限制性内切酶缓冲液,并用适当的限制性内切酶切割,以便从载体中回收片段。 10. 酚抽提和乙醇沉淀DNA。DNA重悬于10~15 μl 洗脱缓冲液,并加0.5 μl 2 mg/ml RNA酶A,37℃温育15 min 以降解担体tRNA。 11. 在非变性的6%聚丙烯酰胺凝胶电泳上,分离从载体上切下的目的片段,凝胶用溴化乙锭染色,切胶,洗脱出DNA。 12. 将纯化的插入DNA连接到具有互补末端的质粒或细菌噬菌体载体中。通过常规的转化程序将连接混合物导入合适的细菌中 |