隔水式恒温培养箱箱体和外箱门采用钢板、表面喷塑，箱门采用钢化玻璃观察窗，能清晰直接观察箱内的培养物品，工作室（内胆）采用不锈钢亚弧焊接制成，可任意改变搁板的高度。外门与箱体磁性门封条，以保证工作室的密封性。隔水式恒温培养箱工作室采用“U”型水箱隔水加热，箱体左上侧有一加水口，左下侧有一放水口，左背后有一溢水橡皮管。工作室后背装有一只低噪声小型风机，保证箱内温度均匀性。隔水式恒温培养箱箱体外壳和工作室间填充超细玻璃棉隔热。

隔水式恒温培养箱控温系统由传感器（Pt100铂电阻）、温度控制器、加热器等组成，当温度控制器接受传感器输出电阻信号（0℃时为100Ω，0.3Ω/℃）后，在PV屏显示工作室内测量实际温度，当输入信号小于设定值时，功率管（双向可控硅）导通，使加热器获得足够的电功率产生热量。反之，功率管无电功率输出加热器不加热。隔水式恒温培养箱温度控制器具有PID调节输出特性、电功率输出大小可调、测量温度的误差校正、定时控制及改变等功能及超温或高、低水位有灯光及自动切断输出报警的安全功能。