MaxUPII建库试剂盒
时间：2017-10-23 阅读：617
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit
——文库转化率高达60%，极其适用FFPE、cfDNA样本
DNA 文库构建是NGS样本制备的核心环节。文库质量直接影响测序数据质量——如mapping rate、coverage、complexity、bias等。要想获得好的文库，必须选择好的建库试剂盒，而建库试剂盒的关键，在于其文库转化率，即DNA双端接头连接效率，因为只有双端连接成功的DNA，才能够被有效扩增zui终成为测序模板。
产品特点
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®，采用高质量的酶学组成，改进型接头连接技术，以及具有强扩增效率的高保真酶，显著提高文库转化率与扩增效率，助理完成更好。
1. 文库转化效率高达60%
文库转化率，即DNA样本双端接头连接效率。只有双端连接成功的DNA，才能够被有效扩增zui终成为测序模板。
图1 Agilent 2100 检测350bp平末端DNA单端和双端连接产物峰。
0：350bpDNA峰、1：单端接头连接产物峰、2：双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准 protocol进行。
图2 接头连接效率百分比（%）。
对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%。
2. 不同GC样本，扩增效率测试
Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增。以1 ng GC含量分别为38%、50%、70%的400 bp DNA为起始样本，12 cycles扩增，Qubit检测不同试剂盒所得产物浓度，Super Canace表现。
表1 扩增模块效率比较。
产品名称 | GC 38% (ng) | GC 50% (ng) | GC 70% (ng) |
Super CanaceTM High-Fidelity Mix | 25.6 | 18 | 17.1 |
K*-HiFi mix | 15.8 | 16.7 | 21.1 |
3. FFPE、cfDNA样本, 文库产量测试
Hieff NGS™ MaxUp II Kit以FFPE和cfDNA为起始样本建库，相对同类型试剂盒品牌 K*，在相同扩增循环数下，获得更多文库产量。
表2 FFPE、cfDNA样本文库产量比较。
样本 | 100 ng FFPE | 5 ng cfDNA | ||
7 cycles (ng) | 10 cycles (ng) | 9 cycles (ng) | 12 cycles (ng) | |
MaxUP II | 400 | 2000 | 120 | 1200 |
K* 品牌 | 150 | 1100 | 100 | 1080 |
注：FFPE样本来自小鼠肺蜡块，固定时间6个月；cfDNA样本来源于血浆。
4. 无偏好性的测序质量
在不同GC含量样本中，使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。
表3 不同GC样本测序数据
样本 | Mapped Reads (%) | Coverage (%) | ||||
Average | 5× | 10× | 15× | 20× | ||
蜡状芽孢杆菌（GC 34%） | 93.8 | 99.644 | 99.643 | 99.641 | 99.639 | 99.638 |
大肠杆菌（GC 51%） | 92.7 | 93.057 | 92.782 | 92.687 | 92.625 | 92.579 |
嗜盐杆菌（GC 65%） | 94.2 | 99.598 | 99.028 | 98.391 | 97.885 | 97.419 |
蜡状芽孢杆菌（GC 34%） 大肠杆菌（GC 51%） 嗜盐杆菌（GC 65%）
图3 不同GC含量样本测序偏好性图谱。
5. 2.5小时内
表现如此，使用起来也非常方便哦!
订购信息
产品 | 货号 | 规格 | 价格（元） |
Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12200ES08/24/96 | 8/24/96libraries | 2456/6486/23567 |
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