甲基化分析的常见问题解答
时间:2016-04-06 阅读:2352
常见问题解答:
Q:在用Zymo的重亚硫酸盐试剂盒处理前,起始DNA样本应该储存在TE,水,还是其他缓冲液中?
A:水和TE缓冲液均可用来储存DNA,并且不会对转化过程造成干扰。
Q: 为什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit,我的DNA没有得到*的转化?
A: 1) 如果是固体样本,很可能是处理的样本量过大,而导致不*DNA转化;
2)如果是FFPE组织样本,有可能是DNA已大规模受损以及/或者交联,导致不*转化;
3)如果在Proteinase K消化后,没有通过离心去除碎片,则可能会干扰重亚硫酸盐转化过程,导致DNA的不*转化;
Q: 为什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化(96孔板)产品线有两种不同的目录号?
A: 这两种不同的目录号是用来区分试剂盒内不同类型的96孔板。深孔板和浅孔板均适用于大多数离心机和微板架。如下阐释了这两类96孔板的区别:
Silicon-A | Zymo-Spin I-96 | |
款式 | 浅孔 | 深孔 |
尺寸(H x W x L) | 19 mm x 83 mm x 125 mm | 35 mm x 83 mm x 125 mm |
结合/收集板组合高度 | 43 mm | 60 mm |
结合力/zui小洗脱体积 | 5µg/30µl per well | 5µg/15µl per well |
货号 | D5003, D5007, D5022, D5032 | D5004,D5008, D5023, D5033 |
Q: Zymo 重亚硫酸盐处理试剂盒与illumina技术平台兼容吗?
A: 是的,Zymo的EZ DNA Methylation Kit技术被illumina推荐使用在其GoldenGate和Infinium Assays平台上;
Q: 用Zymo的EZ DNA Methylation Kit转化得到的DNA可用作哪些下游分析应用?
A: 用Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit转化得到的DNA,可适用于后续的各类测序分析法,Ms-SNuPE, COBRA, Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如: Sequenom的EpiTYPER), 以及其他分析方法。