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上新!一种新型固相烷基化试剂,助力高效处理蛋白组学样本

时间:2023-10-31      阅读:523

背景


蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平、亚细胞定位、翻译后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生、细胞代谢、生长发育以及各种胁迫反应等过程的整体而全面的知识。




随着生物质谱技术迅速发展,质谱技术已经逐渐成为了蛋白质组学分析的主流技术。质谱仪器具有高灵敏度、高分辨率等特点,样本前处理的质量和可重复性显著影响质谱仪的分离和鉴定能力。


蛋白质组学样本前处理流程复杂、处理时间长(传统蛋白质组前处理需过夜),造成了样品前处理不稳定、样品质量参差不齐,重现性差等问题,急需一种高效、高回收率、抗干扰能力强的蛋白质组学分析的前处理方法。






蛋白质组学分析流程






产品介绍




睿科集团全新推出的蛋白组学样本前处理试剂盒,其中的关键组分是一种新型固相烷基化试剂,与传统的烷基化试剂相比,采用新型固相烷基化试剂,蛋白质可与其它小分子(如糖、盐、表面活性剂、脂类等)实现快速分离,提高蛋白质的纯度,显著降低样本复杂程度。同时,试剂表面亲水性较好,可显著提高蛋白质或酶解产物的回收率。产品适用于处理各种来源的蛋白质组样品,如细胞、血浆、细菌、肿瘤组织等




睿科蛋白组学样本前处理试剂盒

(新型固相烷基化试剂)






产品特点




一、高效



操作简便、高效,一站式覆盖蛋白质组提取到消化的所有步骤



二、高回收率



蛋白质组处理回收率高,可满足纳克至微克级别蛋白质组样品的处理需求



三、抗干扰



抗干扰能力强,对样品中表面活性剂、有机试剂、各种酸碱缓冲溶液等均可耐受



四、适配自动化



除手动操作外,可适配睿科自动化前处理设备






产品测试数据






使用试剂盒对293T细胞处理后进行重复性验证




材料:用 6M 盐酸胍超声裂解 293T 细胞离心获得

实验方法:随机选取2批次试剂,将同一样品分为6份,每批次试剂各做3个平行样品,使用蛋白组学样本前处理试剂盒流程处理后,将样品进行Q Exactive质谱检测。




Q Exactive质谱检测结果如下:



表1:不同批次前处理试剂处理293T蛋白样品QE质谱检测蛋白数及零漏切率


图1:不同批次试剂处理293T蛋白样品质谱检测重复性Pearson Correlation Coefficient均>0.99






使用试剂盒对E. coli 样本处理后进行重复性验证




材料:用 6M 盐酸胍超声解 E. coli 离心获得

实验方法:随机选取2批次试剂,将同一样品分为6份,每批次试剂各做3个平行样品,使用蛋白组学样本前处理试剂盒流程处理后,将样品进行Q Exactive质谱检测。




Q Exactive质谱检测结果如下:



表2:不同批次前处理试剂处理E.coli蛋白样品QE质谱检测蛋白数及零漏切率

图2:不同批次试剂处理E.coli 蛋白样品质谱检测重复性Pearson Correlation Coefficient均>0.99






■ 实验总结



对293T 细胞和E. coli 样本分别用两批次试剂进行前处理,批间的重复性测试表明可检测到的蛋白数及零漏切率基本一致,达到预期要求;检测结果皮尔斯相关系数介于0.991-0.996之间。说明不同批次试剂实验结果重复性好




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