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CUT和Tag: 新型蛋白质-DNA互作研究工具

时间:2024-06-14      阅读:672

表观遗传学研究中,在分子层面研究蛋白质与DNA之间的相互作用有助于我们更深入的理解特定细胞功能和疾病发病机制。CST为了帮助科研人员更快的获得可靠的实验结果,进一步扩大了蛋白质-DNA互作研究产品组合,重磅推出了完整的CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)解决方案,包括CUT&Tag试剂盒(#77552)、 建库试剂盒(#47415)、抗体和适用于细胞以及组织的实验步骤说明书。

 

CUT&Tag实验步骤

对于CST CUT&Tag实验,首先将细胞与刀豆蛋白A包被的磁珠混合。洋地黄皂苷的透化处理可以让靶标特异性的一抗进入细胞并结合目的蛋白。由于需要将信号放大,因此还要添加二抗。随后进行预装接头的高活性CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded) (#79561)融合转座酶的孵育,转座酶进入细胞后可以通过pAG结构域与二抗结合,这样就使转座酶与靶标蛋白间接联系起来。加入Mg2+激活转座酶活性后,目标基因组 DNA 会被切割并就地连接接头 DNA,最后进行DNA纯化和PCR扩增。由于省去了体外接头连接步骤,CUT&Tag可以节省您宝贵的时间,让您在更短的时间内进行蛋白质-DNA相互作用研究。

 

图1:CUT&Tag 实验原理

CUT&Tag为何与众不同?

虽然ChIP仍然是研究蛋白质-DNA相互作用的主要方法,但随着新的研究工具的出现,例如CUT&RUN以及CUT&Tag,传统ChIP-Seq实验需要大量样品,重复性差、高背景等问题得到了解决。CST CUT&Tag试剂盒(#77552)经过了严格验证,适用于细胞和组织样品中多种靶标类型,并包含了阳性对照抗体Tri-Mmethyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751和阴性对照抗体Normal Rabbit IgG #2729 / Normal Mouse IgG #68860,以及抗兔和抗鼠的二抗。同时,当样品量不足时,该试剂盒还可以帮助您更快获得实验结果,节省测序成本,并使单细胞染色质分析成为可能。

 

图2:CUT&Tag优势

此外,CST还专门针对CUT&Tag验证了多种一抗,包括组蛋白靶标和部分非组蛋白靶标,以确保实验结果的可重复性和可靠性。

CUT&Tag 试剂为您提供高质量数据

一、组蛋白修饰分析

1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对HCT 116细胞进行CUT&Tag实验。
 


2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对低细胞数量的NCCIT细胞进行CUT&Tag实验。

 

 

二、转录因子和辅因子分析

1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822对F9细胞进行CUT&Tag实验。

 

 

2、使用  JARID2  (D6M9X)  Rabbit  mAb  #13594  对NCCIT细胞进行CUT&Tag实验。

 

 

3、使用ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb #11815对低细胞数量的Hep G2细胞进行CUT&Tag实验。

 

 

三、组织样品分析
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对小鼠脑组织进行CUT&Tag实验。

 

 

2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对小鼠肝组织进行CUT&Tag实验。

 

 

3、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对小鼠心脏组织进行CUT&Tag实验。

 

 

CST经过严格验证的一站式CUT&Tag解决方案现已全面上线:CUT&Tag试剂盒(#77552) + 一抗和二抗 + 建库试剂盒(#47415)

CUT&Tag试剂盒和试剂

货号产品名称规格
77552CUT&Tag Assay Kit1 kit
79561CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded)100ul
47415CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems1 kit
63228CUT&Tag PCR Master Mix840ul

 

部分CUT&Tag验证抗体列表

货号品名
8173Acetyl-Histone H3 (Lys27) (D5E4) Xpe Rabbit mAb
9649Acetyl-Histone H3 (Lys9) (C5B11) Rabbit mAb
52885Anti-mouse secondary Ab
35401Anti-rabbit secondary Ab
11815ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb
6964Bmi1 (D20B7) Xe Rabbit mAb
5856Bmi1 (D42B3) Rabbit mAb
25069CBX2 (EЗN6A) Rabbit mAb
14696CBX8 (D208C) Rabbit mAb
3418CTCF (D31H2) Xpe Rabbit mAb
9725Di-Methyl-Histone H3 (Lys4)(C64G9) Rabbit mAb
4658Di-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D85B4) Xp® Rabbit mAb
32578DNMT3A(D2H4B) Rabbit mAb
57868DNMTЗB (E8A8A) xpe Rabbit mAb
85322EED (E4L6E) XP® Rabbit mAb
5246Ezh2 (D2C9) XP³ Rabbit mAb
5851GATA-6 (D61E4) Xp® Rabbit mAb
42427Helios (D8W4X) XP³ Rabbit mAb
13594JARID2 (D6M9X) Rabbit mAb
97800MITF (D3B4T)Rabbit mAb
14689MLL1 (D2M7U) Rabbit mAb (Amino-terminal Antigen)
14111Mono-Methyl-Histone H3 (Lys36) (D9J1D) Rabbit mAb
5326Mono-MethylHistone H3 (Lys4) (D1A9) Xp® Rabbit mAb
5232Nanog (D73G4} XP® Rabbit mAb (ChiP Formulated)
68860Normal Mouse lgG
13499Phospho-Rpb1 cTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb
13546Phospho-Rpb1 cTD (ser2/ser5) (D1G3K) Rabbit mAb
2729Rabbit lgG
2629Rpb1 CTD (4H8) Mouse mAb
11956SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb
2569TCF4/TCF7L2 (C48H11) Rabbit mAb
9733Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb
9751Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb
5737Tri-Methyl-Histone H4 (Lys20)(D84D2) Rabbit mAb
8240ubiquityi-Histone H2A (Lys119} (D27C4) Xpe Rabbit mAb

 

部分相关产品

货号产品应用
56383SSimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit超声法,磁珠,可应用于ChIP,ChIP-seq
9005SSimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) 酶解法,磁珠,可应用于ChIP,ChIP-seq
9004SSimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)酶解法,琼脂糖珠,可应用于ChIP
9003SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads)酶解法,磁珠,可应用于ChIP,ChIP-seq
9002SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)酶解法,琼脂糖珠,可应用于ChIP
abs50034染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒蛋白 A/G 磁珠,超声法,,可应用于ChIP,ChIP-seq
86652CUT&RUN Assay KitCUT&RUN
40366CUT&RUN pAG-MNase and Spike-In DNACUT&RUN
48105CUT&RUN 4X Stop BufferCUT&RUN
42015CUT&RUN DNA Extraction BufferCUT&RUN
15338Antibody Binding Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
3141510X Wash Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
14209DNA Purification Buffers and Spin Columns (ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag)ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag

 

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