实验室中的器具分为：玻璃仪器、金属仪器、橡胶制品及塑料制品等，每一种消毒措施都不同，严格的按照标准进行消毒时非常重要的环节。而目前常常用到的消毒方式有物理方法和化学方法两种。

其中实验室物理方法包含：干热灭菌法、湿热灭菌法、过滤除菌法、射线杀菌法等

1.    干热灭菌法：利用恒温干燥箱内120℃~150℃的高热，持续90·120分钟，杀死细胞和芽孢，主要适用于易破损的玻璃器皿、金属器械已经不能和蒸汽接触的物品灭菌

2.    湿热灭菌法：压力蒸汽湿热灭菌法，利用高压蒸汽以及蒸汽环境中存在潜热作用和良好的穿透力，使菌体蛋白质凝固变形而使微生物死亡

3.    射线灭菌法：利用紫外线进行照射灭菌，利用低能量的电磁辐射，可以杀灭多种微生物，作用于机制是通过微生物的核酸及蛋白质等的破坏作用而使其灭活。

4.    过滤除菌法：将液体或者气体通过有为空的微膜过滤，使大于滤膜孔径的细菌等微生物颗粒阻留，从而达到除菌方法

5.    化学消毒剂消毒法：用于不利于用物理方法进行灭菌的物品、空气、环境、器械、工作面、操作者皮肤、某些实验器皿等，常用化学试剂进行消毒，在使用时应注意安全，特别在皮肤或实验材料商的消毒剂。

而在消毒剂的使用中常用的包括甲醛、高锰酸钾、70%-75%乙醇、过氧乙酸、过氧化氢、银离子复合型、来苏尔水、环氧乙烷、碘伏或碘酊等。