酶标仪检测移液到微孔板中的样品产生的光信号。这些样品的光学特性是生物、化学、生化或物理反应的结果。不同的分析反应导致用于分析的不同光学变化。吸光度、荧光强度和发光是全球实验室常用的检测模式。此外，还提供荧光偏振、时间分辨荧光和 AlphaScreen® 等高级模式。

基于微孔板的测量检测由样品产生、由样品转换或通过样品传输的光信号。信号由检测器测量，通常是光电倍增管 (PMT)。 PMT 将光子转化为电能，然后通过酶标仪进行量化。此过程的输出是量化样本的数字。

根据反应过程中光信号变化的性质以及检测模式，样品可能需要被特定波长的光激发。这种光通常由宽带氙气闪光灯提供。为了仅通过特定波长激发样品，灯产生的光由特定的激发滤光片或单色器选择。为了提高灵敏度和特异性，在发射/检测端同样采用过滤器或单色器。它们通常放置在样品和检测器之间。