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暨南大学Nature子刊发表重要测序成果

时间:2016-07-04      阅读:444

暨南大学和南加州大学的研究人员通过长读取测序技术从头(de novo)装配了一个高质量的中国人基因组。这项研究成果发表在七月一日的Nature Communications杂志上,文章通讯作者是南加州大学Kai Wang教授、暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院的苏国辉(Kwok-Fai So)教授和周立兵(Libing Zhou)教授。 
生物通报道:随着测序成本的持续下降,人们已经破译了许多生物的基因组。不过新一代测序产生的读取数据大多比较短,在分析重复元件的时候存在一定的技术限制,而这样的元件在人类基因组很常见。为了更好的描述人类的复杂基因组区域,可能还需要用到其他的基因组分析技术。
暨南大学和南加州大学的研究人员通过长读取测序技术从头(de novo)装配了一个高质量的中国人基因组。这项研究成果发表在七月一日的Nature Communications杂志上,文章通讯作者是南加州大学Kai Wang教授、暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院的苏国辉(Kwok-Fai So)教授和周立兵(Libing Zhou)教授。生物通 www.ebiotrade。。com 
研究人员用单分子实时测序(SMRT)技术对一个中国人(HX1)进行了DNA和RNA测序,还用芯片生成了HX1基因组的物理图谱。他们将长读取测序和芯片数据结合起来,从头装配了中国人基因组HX1。
研究显示,长读取测序能够*参考基因组GRCh38的缺口,更好的鉴定基因组结构变异。长读取RNA测序可以发现新的转录元件,特别是剪接异构体。研究人员指出,用多种基因组技术研究不同人群有助于更好地认识人类基因组。
 

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