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罗氏454测序完成倭黑猩猩基因组草图测序

时间:2013-08-05      阅读:1134

       近期,一个研究小组在《Nature》1杂志报道倭黑猩猩(Bonobo)基因组测序完成。利用完成的倭黑猩猩基因组图谱,以及另外19个倭黑猩猩及黑猩猩(Chimpanzee)基因组的测序数据,研究人员不仅研究了倭黑猩猩的基因组,也对不同倭黑猩猩、黑猩猩及人类基因组进行了比较。
       研究人员首先利用454测序系统对一只来自刚果Leipzig动物园的雌性倭黑猩猩基因组进行测序,获得了2.7Gb的序列,拼接出倭黑猩猩的基因组图谱,其正确可达为99.98%,与现有的黑猩猩基因组数据质量相似。
       结果印证了之前对非洲猿(ape)进化史的认识,即倭黑猩猩及黑猩猩祖先约100万年前在中部非洲分离,晚于非洲猿与人类祖先分化数百万年。倭黑猩猩基因组的99.6%与黑猩猩基因组一致,而与人类基因组的一致度略低在98.7%。研究人员推测倭黑猩猩与黑猩猩的分化事件发生在150-120万年前刚果河形成的时期,这也使得这两个物种被分割开因而没有再发生种间交配。
       同时,此次研究也给人类及非洲猿进化历史带来了新的线索,比如在人类的基因组中也存在一些区域,相比倭黑猩猩与黑猩猩基因组两者之前的差异,人类基因组序列可能更接近于倭黑猩猩或黑猩猩的序列。这样的区域总量超过人类基因组的3%以上,其中约1.6%的基因组人类与倭黑猩猩更相似,约1.7%的基因人类与黑猩猩更为相似,推测可能这些区域与倭黑猩猩及黑猩猩进化历*发生的重大的群体性选择事件相关。
      倭黑猩猩和黑猩猩在许多、复杂的性状特征上与人类有相似之处,如群体组织、社交行为;倭黑猩猩性格活泼并性行为活跃,而黑猩猩更具有攻击性和竞争意识。研究人员下一步将通过对三者基因组异同及基因的特征特点的分析,推测在进化中关键的基因组事件,进而将一些包括行为学特征在内的性状与基因特征相互关联,以帮助解答这些性状的遗传学基础的问题。

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