气相色谱质谱联用仪原理是用色谱分离混合物，利用质谱做为检测器，检测分离出的每一个化合物都是什么，这样就不用做标准样了。气相色谱用于分离混合物，得到单一组分；质谱用于测定单一组分的分子量，可以用来定性、定量分析。

　　气相色谱质谱联用仪的分析思路：

　　当柱温、汽化室温度设定好后,按START键,开始升温到设定的温度。当柱室温度达到所设定温度±1℃以内时,READY灯亮。但因温度稳定达到所设定值之前,会略有波动,REDAY灯会闪烁一、二次,但很快就会稳定.当柱箱和汽化室温度达到设定的温度时,就可以进样分析了。

　　气相色谱质谱联用仪的数据处理：

　　1.接通电源开关

　　全部指示灯点亮约需1秒钟,其后,指示灯的闪烁约持续30秒钟.其间,如果没有不良情况,READY的指示灯点亮。

　　2.设定记录器的灵敏度

　　如设定灵敏度为8时：ATTEN 3 ENTER；设定送纸速度10：SPEED 10 ENTER。

　　3.划出色谱仪的基线

　　操作SHIFT DOWN PLOT ENTER键,一直等到色谱仪的基线稳定为止。再一次操作SHIFT DOWN PLOT ENTER键,则作图停止。

　　4.打印色谱仪的零点的偏离（单位：uV）按动PRINT键,再按着CTRL键,按动LEVEL键。放开LEVEL键后,再放开CTRL键。接着按动ENTER键（注意：CTRL键必须比目的键LEVE*按,比目的键后放开）。

　　5.调整色谱仪的零点,使之进入-1000uV到+5000uV之间的范围.反复进行4-5项操作。

　　6.记录笔移至原点，操作ZERO ENTER键。

　　7.进样分析在色谱分析仪中注入试样,同时按动START键。