膜蛋白分离方法
时间:2015-09-15 阅读:2668
1 细胞质膜资料
1895 年 ,Overton 从研究细胞透性得出 " 细胞膜由连续的脂类物质组成 " 。
1925 年 Gorter&Grendel: 用脂单分子膜技术测定细胞膜中脂分子的总面积,提出: "细胞膜是由双层脂分子组成 " 。
1935 年 Danielli&Davson :从测定膜的表面张力得出细胞膜的 " 三明治结构模型 ",即蛋白质-脂 - 蛋白质。
1959 年 Robertson: 用电镜观察生物膜提出 " 单位膜模型 " ,将膜的分子结构与超微机构统一起来
厚度: 2( 暗 ) 3.5( 亮 ) 2 (暗) =7.5
细胞质膜的主要功能概括如下:
(1) 为细胞的生命活动提供相对稳定的内环境 ;
(2) 选择性的物质运输,包括代谢底物的输入与代谢产物的排除,其中伴随着能量的传递;
(3) 提供细胞识别位点,并完成细胞内外信息跨膜传递;
(4) 为多种酶提供结合位点,使酶促反应而有序地进行;
(5) 介导细胞与细胞、细胞与基质之间的连接 ;
质膜参与形成具有不同功能的细胞表面特化结构。
2 膜蛋白
虽动物细胞主要有 9 种膜脂,而膜蛋白的种类繁多,多数膜蛋白分子数目较少,但却赋予细胞膜非常重要的生物学功能。
根据膜蛋白分离的难易及其与脂分子的结合方式,膜蛋白可分为两大类型:外在膜蛋白、内在膜蛋白。
(1) 外在膜蛋白为水溶性蛋白,靠离子键或其它较弱的键与膜表面的蛋白质分子或脂分子结合,因此只要改变溶液的离子强度甚至提高温度就可以从膜上分离下来,膜结构并不被破坏。
(2) 内在膜蛋白与膜结合非常紧密,一般讲只有用去垢剂 (detergent) 使膜解后才可分离出来。
获得大量有生物学活性的质膜蛋白对我们显得非常的重要。
附注:使用分级抽提方法获得的“膜蛋白”中只有很少一部分是具备多跨膜区的整和膜蛋白,膜蛋白,到目前为止,仍然是蛋白组学的一个瓶颈,不管采用2-D技术也好,ICAT乃至proein microarray 都还不能有效解决这一问题。
二、蛋白抽提
谈及蛋白分离,我们想到:超速离心,盐析法、超滤法、凝胶过滤法、等电点沉淀法、离子交换层析、亲和层析、吸附层析、逆流分溶、酶解法……有时这些方法常常组合到一起对特定的物质进行分离纯化。由于蛋白质种类繁多,不同的蛋白质由于结构和组成的差异,其溶解度也各不相同. 根据蛋白质的溶解特性,同时可选择不同的溶剂提取,分为水溶液提取和有机溶剂提取 .
但是针对膜蛋白的提取与细胞质蛋白,核蛋白提取不同之处在于它是嵌在膜中的,水溶性不好,基本方法就是用不同的离心速度去掉胞质蛋白等,zui后用去污剂把蛋白从膜中释放出来。膜蛋白分离纯化的重要步骤是选择适当的增溶用表面活性剂,一般常用的有胆酸盐,CHAPS( 一种离子去污剂), Emulgen 和 Lubrol 等表面活性剂。
1 、分离膜蛋白的方法(原则性):
1 )先分离膜,然后提取;如选用冷热交替法、反复冻融法、超声破碎法、玻璃匀浆法、自溶法和酶处理法使得细胞破碎,然后通过剃度离心得到含有膜蛋白的粗组分。(例如:michael11 液氮研磨组织,加入匀浆缓冲液及蛋白酶抑制剂。差速离心。蔗糖密度梯度离心。收集 37% 与 41%间的成分,即为质膜部分。裂解即可收集膜蛋白 )
2 )用特殊的去污剂选择性的分离。 从膜上提取蛋白有许多困难 . 在多数情况下,都是采用去垢剂将疏水蛋白从其膜结构中溶解下来,然后将蛋白质稳定. 去垢剂的选择通常是依据他对所需要蛋白质的提取效率来确定,但在某些情况下,还要考虑到以后的纯化步骤 .虽然许多膜蛋白必须在去垢剂存在的情况下进行纯化,但zui终仍可能需要除去去垢剂 .这常常会引起蛋白质失活,但如果蛋白质是用于测序的,他将不是一个问题 . 如果不是用于测序的,可考虑使用能够黏附去垢剂的疏水珠 .许多文献和生化试剂供应商的产品目录中,都介绍有许多种不同的可用来溶解膜蛋白的去垢剂 . 然而,他们并不是普遍适用的 .在设计膜蛋白溶解方案时,必须考虑某一去垢剂的特殊性质 . 如 triton X-100 在 280nm 处有吸收,如果某蛋白质的测试与280nm 处的吸收有关,就应避免使用这类去垢剂 .
将膜制剂与胞质蛋白及细胞核分离后,再进一步从细胞膜制剂中将所需的膜蛋白增溶下来 .这种做法的好处是可以用强烈的去垢剂提取细胞骨架的相关蛋白,而无需考虑胞质蛋白、细胞核成分或染色质成分的混入 .使用这种方法所获得的膜蛋白,无论在种类上还是数量上,都比酸溶解法所得到的蛋白( <5000Da )要多 .一般提取的膜蛋白量往往只占膜蛋白总量的不足 0.1% ,所以充分的膜蛋白的提取,无疑对于研究膜蛋白的结构和功能都是非常重要的 .第二种方法简单,可靠,但有时含有其他蛋白。一般的都是利用 4 度时所有的蛋白质原则上都溶于 TritonX114 水溶液,在温度超过 20 度时,此溶液分为水相和去污相;此时亲水性蛋白溶于水相,疏水的膜蛋白溶于去污剂相中。利用此性质可提取膜蛋白。
3 ) 膜蛋白色谱 (Chromatography of Membrane Protein,CMP)CMP分离强疏水性蛋白、多肽混合物的层析系统,一般有去垢剂(如 SDS )溶解膜蛋白后形成 SDS-融膜蛋白,并由羟基磷灰石为固定相的柱子分离纯化。羟基磷灰石柱具有阴离子磷酸基团( P- 端),又具有阳离子钙( C-端),与固定相结合主要决定于膜蛋白的大小、 SDS 结合量有关。利用原子散射法研究 cAMP 的分离机制发现,样品与 SDS结合后在离子交换柱上存在 SDS 分子、带电荷氨基酸与固定相中带电离子间的交换,从而达到分级分离的目的。
层析柱提取 http://www.alomone。。com/ (参步骤)
4) 顺序抽提法:根据细胞蛋白溶解性的差异,用具有不同溶解能力的蛋白溶解液进行抽提的方法。用 Tris碱溶液裂解细胞提取高溶解性蛋白;把未溶解的 pellet 用标准液溶解提取高疏水性蛋白;zui后用含复合表面活性剂的蛋白溶解液,zui后可以再次抽提前两次抽提后不能溶解的膜蛋白。
5)centrifugal protein extraction
原理:高渗的蛋白裂解液让细胞溶涨破裂后,超高速离心
评价:尽管分级 ( 胞浆和胞膜 ) 之间有清洗的步骤 , 但是可溶蛋白组分和膜蛋白组分之间仍然有不少重复的点 . 该方法相较 MOLLOYMP 教授在 1998 年 electrophoresis 上发表的分级抽提法减去了*步 ( 用 tris 抽提水溶性蛋白 ) 和zui后一步 (极难溶蛋白 ), 在操作上也作了简化 , 总而言之是一种不错的方法。( codegreen )
6)detergent- based :提取时先裂解液裂胞膜(选用不同的去污试剂是关键),梯度离心分离细胞器 (ER),然后分级抽提方法。例如,去掉细胞器之后的 DEBRIS 就是核膜,再裂解得到核膜蛋白。而膜蛋白是裂胞膜时不溶的部分。
总的感受:细胞的量要很充足。之后的定性鉴定常用的方法有双向免疫扩散、免疫电泳及聚丙稀酰胺凝胶电泳等。纯化蛋白质浓度的定量测定可用双缩脲法、酚试剂法或紫外光吸收法定量鉴定膜蛋白,方便迅速。
到目前为止,提取膜蛋白仍然是蛋白学的一个瓶颈。
2 、分离膜蛋白的方法(操作)
1)分离细胞膜蛋白的方法:
1、冰上刮下细胞后将细胞溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液 A 中,于室温与液氮罐中反复冻融 2 次。
2、5000 转 4 度离心,驱除核及未裂解的细胞。
3、取上清 12000 转 4 度离心 10 分钟取沉淀溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液 B 中。
4、12000 转 4 度离心 10 分钟取沉淀溶于有蛋白酶抑制剂的缓冲液 C 中提取后测蛋白浓度 ,SDS-PAGE 电泳,分装后 -20 度保存备用。
buffer A : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/mlLeupeptin,20uM pmsf(PH=7.4)
buffer B : 1mMkcl,5mMNacl,3mM Mgcl2,50mM Hepes,1mM DTT,0.5ug/mlLeupeptin,20uM pmsf(PH=7.4) 1mM EGTA
buffer C : 0.5ug/ml Leupeptin,20uM pmsf,50mMTris-cl(PH=7.0),
2 )分离细胞膜蛋白的方法:
1 、细胞放在冰上,去除上清,用 pH7 。 4 的冷磷酸盐缓冲液洗涤单层细胞两次
2 、加入 1ml2%TritonX 溶液冰浴 15min
3 、刮下单层细胞, 4 度下 10 000g 5min 离心
4 、溶液 37 度水浴 10min 以分离水相和去污剂相,然后 37 度下 2 000g 离心 5min
5 、收集水相留作分析
6 、用 500ul 冰冷的 buffer C 溶解去污剂相沉淀,冰浴 2min 后加温,在按步骤 6 再次离心
7 、按步骤 8 再次抽提去污剂相,用 buffer C 将洗涤后的去污剂相稀释到初始体积
8 、用等量的 buffer A 分别稀释水相与去污相,并进行免疫沉淀实验
试剂:
1 、 2%tritonX114:2%TritonX114 、 50mmol/L Tris HCl ( pH7 。 5 )、蛋白酶抑制剂
2 、缓冲液 A (含 0 。 5mol/LNaCl 的 RIPA buffer )
3 、 buffer C
10mmol/L Tris HCl(pH7.5)
150mmol/L NaCl
5mmol/L EDTA(PH7.5)
3 )分离细胞膜蛋白的方法:
7M urea
2M thiourea
4%chaps
2.5%sb3-10
1000000 个细胞,可用此 buffer 1ml 。 冰浴匀浆。冰上置 30 分钟。
4 度高速低温离心 30min 。
取上清 -20 保存。
4 )分离组织膜蛋白的方法:
1 、取组织,加入 10ml Buffer A 于冰上充分匀浆。
2 、 J6-HC 离心机 800rpm , 4 ℃离心 10min 后,所得上清液转入超速离心管。
3 、 100000g , 4 ℃离心 1hr 。弃去上清,沉淀用适量的 Buffer B 重悬,冰上孵育 2hr 后分装至 EP 管,Eppendorf 台式离心机 10000rpm , 4 ℃离心 30min 。
4 、收集所得上清液即为膜组份。
Buffer A : 0.32M 蔗糖, 5mM Tris-HCl ( PH 7.5 ), 120mM KCl , 1mM EDTA,1mMEDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml Aprotinin 。冰上预冷。
Buffer B : 20mM HEPES ( PH 7.5 ), 10% 甘油, 2% Triton X-100, 1mM EDTA,1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/mlAprotinin 。 冰上预冷。
5 )分离组织膜蛋白的方法:
RIPA
1XPBS
1%NP40
0.5 去氧胆酸钠
0.1%SDS
以下用时加入
10mg/ml PMSF 异丙醇(终浓度 10ul/ml )
Aprotinin ( 30ul/ml )
1000mM Sodium Orthovandate ( 10ul/ml )
冰冻组织 100mg/ 细胞 1000000 个,可用 RIPA buffer 1ml 。 冰浴匀浆。冰上置 30 分钟。
4 度高速离心 30min , 20000 转低温离心。
取上清 -20 保存。
6 )分离细菌膜蛋白的方法:
1、于 20ml 营养肉汤中培养细菌, 37 ℃, 200rpm 。
2、10000g 、 20min 、 4 ℃离心,去上清。
3、20ml 预冷的 Tris-Mg 缓冲液重悬,同样条件离心,再重悬于预冷的 Tris-Mg 缓冲液。
④ 超声波破碎细菌。
⑤ 3000g , 10min 、室温下离心去除未破碎细菌。小心吸取上清(含有胞质成分和细菌外被成分)。
⑥ 超速离心 I : 100,000g , 60min , 4 ℃,去除上清(胞质成分),收集细菌外被成分。
⑦ 用 10ml 含 2 %的 SLS 的 Tris-Mg 缓冲液重悬沉淀物,室温温育 20-30min 。
⑧ 超速离心 II : 70,000g , 60min ,室温沉淀收集外膜蛋白,去除上清(含细胞质膜)。重复⑦、⑧两步。
⑨ 充分吸除上清,并根据沉淀体积大小用 0.1-0.2 ml 的 ddH2O 重悬沉淀物。根据公式:蛋白浓度 (mg/ml)=1.450D280-0.740 D260 测定外膜蛋白浓度,调节蛋白浓度至 40ug/ul ,该蛋白质样品 -70 ℃贮存。
试剂
① Tris-Mg 缓冲液
10mM Tris-Cl
5mM MgCl2
pH 7.3 , 4 ℃保存
② 2%(w/v) 十二烷基肌氨酸钠 (SLS)
7 )来源于 Methods Enzymology (1974)
1、取一定量酶处理的细胞,用匀浆器破碎,操作要温和,使细胞膜保持完整。由于水与膜的疏水部分之间有反应,因此要掌握分离介质中的离心强度和渗透压,以每克细胞湿重加40ml 介质。
2 、用 Potter-Elvehiem 匀浆器,杆与壁间间隙 0.5 ~ 0.6 μ m,14.4kr/min 上下匀浆 4 ~ 6次,每次 5S 。
3、过滤匀浆液, 150g 离心 10min ,保留上清,沉淀部分加入 50 μ l 介质,用匀浆器 1kr/min 匀浆 3 次, 150g离心 10min ,沉淀部分再加入上次匀浆的上清液。
4、合并 3 次上清液, 2kg 离心 10min ,弃上清,沉淀部分溶于 100 μ l 介质,离心 10min ,弃上清,留沉淀。
5、将沉淀部分加入 70% 蔗糖 15 份,然后分别置于三个离心管中,上面依次叠加 54% 、 49% 、 45% , 41% , 37%蔗糖溶液各 2 、 2 、 5 、 5 、 3 份。
6、 700kg 离心 90min ,分离介质在 1.16 ~ 1.18 之间形成介面。
7、收集 d 为 1.16 ~ 1.18g/ml 之间的细胞膜,加 30 倍的介质以 2.5kg 离心 10min ,洗涤 2 次。
8、保存于 2.7mmol/L Tris-HCl pH7.5 缓冲液中,用于细胞膜的研究分析
8 )常用的制备粗制质膜组分的方法:(所有操作都在 4 摄氏度下进行)
1. 在冰冷的匀浆缓冲液中切碎组织块,倒出血水。用匀浆缓冲液漂洗组织碎块,并将它们置于冰上,重复上述操作,直至组织碎成 1mm3 大小的碎片,且无可见的血。
2. 加入 5 倍(体积比)与组织块体积的缓冲液,再置于冰浴的 Dounce 氏玻璃匀浆器中,抽研 10-20 次,匀浆组织。
3. 匀浆 4 摄氏度 600g 离心 10min ,上清含细胞膜、线粒体和细胞溶胶。沉淀中有未破碎的细胞及细胞核。弃沉淀。
4. 上清 4 摄氏度 8000g 离心 10min ,沉淀线粒体。弃沉淀。
5. 上清 4 摄氏度 10000g 离心 20min ,弃上清。
6. 用匀浆缓冲液重悬沉淀,继续匀浆,再次 4 摄氏度, 10000g 离心 20min ,弃上清。
7. 用小体积的适宜缓冲液重新*匀浆沉淀。
8. 粗制的样品可于干冰 / 乙醇中速冻,保存于 -80 摄氏度。
9 )用特殊的去污剂选择性的分离。
简单,可靠,但有时含有其他蛋白。
原理: 4 度时所有的蛋白质原则上都溶于 TritonX114 水溶液,但在 37 度时,此溶液分为水相和去污相;此时亲水性蛋白溶于水相,疏水的膜蛋白溶于去污剂相中。
方案
1 、放射性标记受试细胞
2 、将标记的细胞放在冰上
3 、去除上清,用 pH7 。 4 的冷磷酸盐缓冲液洗涤单层细胞两次
4 、加入 1ml2%TritonX 溶液冰浴 15min
5 、刮下单层细胞, 4 度下 10 000g 5min 离心
6 、溶液 37 度水浴 10min 以分离水相和去污剂相,然后 37 度下 2 000g 离心 5min
7 、收集水相留作分析
8 、用 500ul 冰冷的 buffer C 溶解去污剂相沉淀,冰浴 2min 后加温,在按步骤 6 再次离心
9 、按步骤 8 再次抽提去污剂相,用 buffer C 将洗涤后的去污剂相稀释到初始体积
10 、用等量的 buffer A 分别稀释水相与去污相,并进行免疫沉淀实验
试剂:
1 ) 2%tritonX114:2%TritonX114 、 50mmol/L Tris HCl ( pH7 。 5 )、蛋白酶抑制剂
2 )缓冲液 A (含 0 。 5mol/LNaCl 的 RIPA buffer )
3 ) buffer C
10mmol/L Tris HCl(pH7.5)
150mmol/L NaCl
5mmol/L EDTA(PH7.5)
10 )植物中:高度纯化的质膜是质膜蛋白研究的基础,制备纯化方法也很多,植物材料中以
1、蔗糖密度梯度离心、
2、水溶性双水相法、
3、自由流电泳等方法为主。