气相色谱仪系统由储液器、泵、进样器、色谱柱、检测器、记录仪等几部分组成。

储液器的流动相被高压泵打入系统，样品溶液经进样器进入流动相，被流动相载入色谱柱(固定相)内，由于样品溶液中的各组分在两相中具有不同的分配系数，在两相中作相对运动时，经过反复多次的吸附-解吸的分配过程，各组分在移动速度上产生较大的差别，被分离成单个组分依次从柱内流出，通过检测器时，样品浓度被转换成电信号传送到记录仪，数据以图谱形式打印出来液相色谱仪主要有进样系统、输液系统、分离系统、检测系统和数据处理系统。

FID氢火焰气相色谱仪的组成结构：

载气系统：包括气源、气体净化、气体流速控制和测量

进样系统：包括进样器、气化室（将液体样品瞬间汽化为蒸气）

色谱柱和柱温：包括恒温控制装置（将多组分样品分离为单个）

检测系统：包括检测器，控温装置

记录系统：包括放大器、记录仪、或数据处理装置、工作站

气相色谱仪工作原理：是利用试样中各组分在气相和固定液液相间的分配系数不同，当汽化后的试样被载气带入色谱柱中运行时，组分就在其中的两相间进行反复多次分配，由于固定相对各组分的吸附或溶解能力不同，因此各组分在色谱柱中的运行速度就不同，经过一定的柱长后，便彼此分离，按顺序离开色谱柱进入检测器，产生的离子流讯号经放大后，在记录器上描绘出各组分的色谱峰。