Oligo高通量DNA合成仪
时间:2019-06-04 阅读:738
丹麦TAG COPENHAGEN A/S是的核酸合成仪的供应商之一,公司致力于为为客户提供多类型、高稳定、易操作、低消耗的OligoMaker系列DNA/RNA合成仪。
OligoMaker系列产品范围包括实验室型、中试型和工业型等多种。产品包括OligoMaker 12、OligoMaker 24、OligoMaker 48、OligoMaker 96、OligoMaker 192等。OligoMaker系列DNA/RNA合成仪产物用途及其广泛,可用于普通引物合成、全基因合成、PCR、siRNA、特殊探针标记、生物芯片、测序及免疫等领域。
Oligo高通量DNA合成仪用于合成结构上类似DNA或RNA的寡核苷酸的自动化仪器。一般应用于固相合成法,每次将一个核苷酸加到所接长的寡核苷酸链上,加入每一个核苷酸都利用相同的化学反应与相应的嘌呤或嘧啶碱基衍生物作用。
Oligo高通量DNA合成仪特点:
包括一个灵活的合成协议编辑器,它允许操作员修改所包含的协议,并将它们保存在一个新名称下,或者从头开始编写协议。协议编辑可以在Excel中完成。对于不同的合成规模和序列长度,很容易编辑特殊协议。比如,可以给耦合缓慢的碱基对一个特别的延长的耦合时间。如果必要的话,可以给所有单体额外的耦合反应时间。
软件简单易用。在计算机或平板的Excel表中创建运行数据后,可使用Wi-Fi等网络连接或标准U盘传输到仪器上。实验运行中,可以从PC端收集实验数据监测实验结果。
性能
OligoMaker X12可以在1小时内平行合成12条20对的寡核苷酸。
OligoMaker 48可以在2小时内平行合成多达48条20对的寡核苷酸。
OligoMaker 96可以在3小时内平行合成多达96条20对的寡核苷酸。
OligoMaker 192可以在4小时内平行合成多达192条20对的寡核苷酸。
可在IUPAC-IUB标准规则下合成10、50、200和1000nmol规模的核苷酸。
两个反应盘,一个盘可以加载和合成核苷酸,另一个盘准备进行净化步骤。
OligoMaker 48可以升级为OligoMaker 96和OligoMaker 192;
OligoMaker 96可以升级为OligoMaker 192。
DNA的固相合成。即DNA3'端固定于基质上,然后沿3'向5'方向依此添加核苷酸直至合成所需的DNA片段。不同于应用DNA聚合酶的DNA合成。
合成过程
个碱基的3‘末端固定在树脂上,下一个碱基的5’-OH用二对甲氧三苯甲基DMT保护,碱基上的氨基用苯甲酸保护,然后对3‘-OH用氨基磷酸化合物进行活化。
1。1个碱基的5’-OH和下个碱基的3‘-OH形成亚磷酸三酯,
2。然后用碘氧化成磷酸三酯
3。加入C2H6CL2除去第二个碱基5’-OH上的保护剂DMT
循环进行加入下一个碱基
合成完毕后
亚磷酰胺寡核苷酸合成为例介绍该类仪器的一般操作步骤。亚磷酰胺DNA合成的试剂有:保护碱基的5/—DMT,A、G、C、T亚磷酰胺单体,四唑偶联催化剂,乙酐,N—甲基咪唑封闭试剂,TCA脱保护溶液,12氧化混合物,乙腈清洗溶剂,氨水切除溶液。使用步骤如下:
1、仔细检查合成仪上所有试剂瓶中的试剂量,必要时换掉试剂瓶,特别注意乙腈的量,因为该溶剂用量较大。
2、将标记好的清洁的收集瓶装在合成仪上。
3、将要合成的DNA序列输入合成仪。
4、检查选择的合成步骤是否正确。
5、选择结束方法:TritylOffAuto是仪器的原始状态,若打算以5,—DMT基团连接纯化寡核苷酸,将其转变为TritylOnAuto结束状态。
6、选择结束方法,一般为系统的原始状态。
7、在每个柱监视器的Username下,输入你所希望的保存名字。
8、以代码代替相应的DNA序列标记每一个收集瓶。
9、打印出每一个柱设置的详细资料。
10、检查打印出来的资料是否正确。
11、运行StartColumn步骤检查每一个柱的位置,确保合成仪上合成柱处于正确的位置。
12、检查连接在合成仪上的溶剂残留(废液瓶)是否充满。
13、如果分部收集器用来收集每个DMT脱保护步骤的流出物,确保试管充分清洁干净,并打开分部收集器,确保DMT废液管路通向分部收集器。
14、启动循环,运行开始程序清洗试剂管路,除去原来的试剂。