分子生物学实验“酶”你不行！
时间：2024-05-14 阅读：356
做了这么多年的分子实验，对于其中的工具酶大家都了解吗？他们的作用原理都知道吗？本期Absin分子小课堂小爱要教大家如何分清这些复杂的酶。
工具酶是一类在DNA重组过程中，用于不同DNA分子的制备、切割、修饰、扩增、核酸分子的标记以及核苷酸序列测定的酶的统称，是基因重组技术所需的工具。根据催化反应特性可分为限制性内切酶、聚合酶、连接酶、逆转录酶等多种类型。
限制性内切酶
限制性内切酶主要从原核生物中发现，以内切方式水解核酸中磷酸二酯键，对外源性的DNA进行切割、水解，被称为“基因剪刀”。限制酶来源于细菌的“限制—修饰”系统，最早发现于20世纪60年代末。根据限制酶的结构与作用方式，可将其分为Ⅰ类限制酶(TypeⅠ)、Ⅱ类限制酶(TypeⅡ)和Ⅲ类限制酶(TypeⅢ)3种类型。其中，Ⅱ类限制酶识别切割位点比较专一，且不具有甲基化酶的活性，在DNA重组中被广泛应用。
爱必信拥有不同的TypeⅡ型限制性内切酶产品：
产品优势：
1、快速：5-15min内即可完成酶切；
2、便捷：共用一种酶切Buffer，简化酶切体系；
3、兼容性高：在不同缓冲液中均具有很高活性；
4、良好酶活冗余度，轻松应对底物过量或困难模板酶切。
货号 | 产品名称 | 规格 |
abs60200 | 快速内切酶ApaLI | 200T |
abs60201 | 快速内切酶AscI | 50T |
abs60202 | 快速内切酶AvrII | 25T |
abs60203 | 快速内切酶BamHI | 500T |
abs60204 | 快速内切酶BclI | 125T |
abs60205 | 快速内切酶BglII | 100T |
abs60206 | 快速内切酶BsaI | 50T |
abs60207 | 快速内切酶BstBI | 100T |
abs60208 | 快速内切酶BstEII | 100T |
abs60209 | 快速内切酶ClaI | 50T |
DNA连接酶
DNA连接酶主要用于基因工程中，将由限制性核酸内切酶“剪”出的粘性末端重新组，故也称“基因针线”。作用原理为DNA连接酶催化双链DNA链一条链上切口的连接，借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-Po4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。T4 DNA连接酶是ATP依赖的DNA连接酶，可催化双链DNA的粘性末端、平末端及RNA-DNA杂合体中单链的连接，在分子生物学中有广泛的应用。
货号 | 产品名称 | 规格 | 特点 |
abs60084 | T4 DNA Ligase | 500U | 该酶不仅能够催化双链DNA的平末端或粘性末端之间的连接，还可以修复双链DNA、RNA或DNA/RNA杂交双链中的单链切刻。 |
DNA聚合酶(DNA polymerase)
DNA聚合酶以DNA为复制模板，从将DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成（在具备模板、引物、dNTP等的情况下）及其相辅的活性。实验室常用的DNA聚合酶有普通耐热型Taq DNA聚合酶、高保真型DNA聚合酶。
货号 | 产品名称 | 规格 |
abs60251 | 重组高热稳定DNA聚合酶 | 1000U |
abs60036 | 2×Taq PCR Mix | 1mL*5 |
abs60056 | 2×Pfu Master Mix | 1mL*5 |
abs601511 | 2 × 预混实时荧光定量快速PCR反应体系 | 1.7mL*3 |
逆转录酶
逆转录酶（反转录酶）又称为依赖RNA的DNA聚合酶。该酶以RNA为模板，以dNTP为底物，根据碱基配对的原则，按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链，这条DNA单链叫做互补DNA (complementary DNA, CDNA)。
货号 | 产品名称 | 规格 | 产品特点 |
abs60073 | Reverse Transcriptase | 10000U | 本酶的RNase H活性缺失，延伸能力强，可用于较长的cDNA合成，高比例的全长cDNA文库的构建以及Real Time RT-PCR反应等。 |
核酸酶
核酸酶主要有三类，分别是：
1、脱氧核糖核酸酶(DNase)：DNase只能水解DNA的磷酸二酯键。胰DNasel可切割双链和单链DNA，产物为5’-磷酸寡核首酸，牛脾DNasell降解DNA则产生3’-磷酸为未端的寡核苷酸；
2、核糖核酸酶(RNase)：将RNA降解为小片段的核酸酶；
3、非特异性核酸酶：将DNA、RNA都可进行水解。
货号 | 产品名称 | 规格 |
abs60539 | 脱氧核糖核酸酶Ⅰ | 1KU |
abs47047435 | 脱氧核糖核酸酶Ⅰ(牛胰) | 100mg |
abs9330 | 核糖核酸酶A | 150uL |
abs44075580 | 核糖核酸酶A | 50mg |
abs60326 | DNase–Free RNA酶A | 1mL |
abs60157 | 全能核酸酶 | 10KU |
其他酶
货号 | 产品名称 | 规格 | 产品描述 |
abs60248 | 双链DNA酶 | 50T | dsDNase也是一种核酸内切酶，能够特异性的消化双链DNA而不会消化单链DNA |
abs60340 | PfAgo核酸内切酶 | 200U | PfAgo核酸内切酶可在5’磷酸化的guide DNA引导下精准剪切单链DNA底物 |
abs9118 | 蛋白酶K | 1g | 主要应用于基因诊断试剂盒、基因组DNA提取试剂盒、RNA提取试剂盒中去除核酸酶和其它蛋白污染 |
FAQ：
1、限制性内切酶无法切割DNA有哪些原因？
a. 内切酶失活：用标准底物检测酶活性；
b. DNA不纯，含有SDS、酚、EDTA等内切酶抑制因子：将DNA过柱纯化，乙醇沉淀DNA；
c. 条件不适（试剂、温度）：检查反应系统是否最佳；
d. DNA不存在该酶识别序列：换用其它的酶切割DNA或过量酶消化验证。
2、酶切后的DNA片段连接效率低？
a. 含磷酸盐的浓度高：透析，乙醇沉淀去除磷酸盐；
b. 内切酶失活或含有ATP酶：更换内切酶；
c. 平末端连接：加大T4 DNA Ligase用量；
d. 连接缓冲液不合适：重新配制连接缓冲液。
3、脱氧核糖核酸酶I(abs60539)浓度、体积怎么换算？用于组织的解离该怎么用？
对于浓度、体积计算：本产品规格为1KU，酶活浓度是5U/mL，总体积则为200uL。根据说明书最后一个表格计算酶体积用量：例如1ugRNA，相应所需酶就是1U，1KU/1U=200uL/需要体积，最后计算得到0.2uL。对于动物组织解离，可以适用，具体操作步骤及使用量可参考网络文献。
4、pfAgo核酸内切酶buffer是否含有金属离子？
Buffer中不含金属离子，对于扩增反应没有任何影响。一般PfAgo酶可以兼容绝大多数PCR buffer，但普通Taq酶不兼容PfAgo buffer。
5、pfAgo核酸内切酶和Ago核酸内切酶（微球）有哪些差别？
两者状态不一样、保存条件不一样；检测方法、使用的效果几乎一样。
名词解释：
酶活性单位：在一定温度、PH及离子强度下，1h内酶解（切割）特定底物DNA，所需酶的量。采用国际单位（IU，简写为U）来统一表示酶活性的大小。
酶活性浓度：以每单位体积所含的酶活性单位数表示。目前几乎都习惯用U/L来表示液体中酶活性浓度。
Absin产品线：
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