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类器官污染鉴别与除菌攻略(一)

时间:2024-10-29      阅读:209

一、概述

 

类器官污染是一个老生常谈的事情,尤其是做胃肠道,组织本身带来的菌群数量非常庞大,一旦消毒不到位,就会导致类器官培养失败。类器官污染常见类型有细菌、真菌、支原体、黑胶虫等污染源,今天小爱带大家学习鉴别类器官污染及除菌方案

 

二、类器官污染鉴别

 

1、细菌污染

 

细菌污染-肉眼下

 

污染特征:

● 肉眼下可明显观察基质内有明显黑色球体物;

● 而且呈多个黑色球状物分布;

● 生长迅速,通常D1就有会出现;

● 培养液隔夜即会变红黄浑浊。

 

细菌污染-镜下类器官原代提取D1

 

细菌污染特征:

● 细菌集落呈黑色团球状,wan全不透;

● 外围模糊,有朦胧感;

● 爆发非常快,一般1-2天即可出现大量集落。

 

细菌克星

货号

抗生素

作用对象

使用比例

储存条件

abs42020125

卡那霉素B硫酸盐

细菌(G+,G-)支原体

母液浓度10mg/mL(无菌水溶解),工作浓度稀释1:100

-20℃

abs42018967

硫酸庆大霉素溶液(10mg/mL)

细菌(G+,G-)支原体

稀释1:200

-20℃

abs9244

青链双抗

细菌(G+,G-)

稀释1:100

-20℃

abs9246

青霉素-链霉素-两性霉素B三抗

细菌(G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

稀释1:100

-20℃

abs9245

青霉素-链霉素-庆大霉素三抗

细菌(G+,G-)、支原体

稀释1:100

-20℃

 










2、真菌污染

 

左图 真菌污染特征——霉菌

右图 真菌污染特征——根霉

 

霉菌污染特征:

● 早期并不会使得培养基变黄变浑浊,但在显微镜下可观察到菌丝体;

● 真菌形成的菌丝呈丝状,管状,树枝状,串珠状

 

真菌污染——酵母菌

 

小鼠胃类器官P0D1中发现的酵母菌团从左到右依次是4X、10X、20X

 

类器官基质胶中的酵母菌污染

 

类器官基质胶中的酵母菌+根霉污染

 

酵母菌污染特征:

● 酵母菌呈类似棉花絮状的团状物;

● 酵母菌等,当其行出芽生殖时可从一大一小的连体结构识别;

● 细胞被污染后,仍可生长,长时间类器官活力状态会变差

● 梅雨季时的污染率会提高。

 

真菌克星

货号

抗生素

作用对象

使用比例

储存条件

abs42013298

两性霉素B

真菌(如:酵母菌,霉菌)

母液浓度2.5mg/mL(DMSO溶解),工作浓度稀释1:1000

-20℃

abs44071148

制霉菌素

真菌(如:酵母菌,霉菌)

母液浓度2mg/mL(DMSO溶解),工作浓度稀释1:100

-20℃

abs9246

青霉素-链霉素-两性霉素B混合溶液(100×三抗)

细菌(如G+,G-)、真菌(如:酵母菌,霉菌)

稀释1:100

-20℃

 








3、黑胶虫

 

 

黑胶虫污染特征:

● 活跃扭动;

● 多呈杆状;

● 培养基不浑浊。

 

黑胶虫清除剂PLUS (500×) abs9841

 

产品优势:

1)性能稳定:通过细菌、真菌、支原体、内毒素检测;通过渗透压、pH检测;通过产品性能检测;

2)高效快速:有效实现对“黑胶虫”的抑制和灭杀,减少不必要的实验损失;

3)环保安全:经上百种细胞验证无毒害作用。

 

使用方法:

1)请在收到货后, 将试剂管瞬时离心(3000rpm,3~5s)保存;

2)使用黑胶虫清除剂处理时, 建议现配现用, 并保持细胞密度在50%~60%

3)推荐稀释比例为1:500。例如5mL培养基中加入10μL的黑胶虫清除剂。丢弃旧的培养基, 用PBS将细胞清洗干净, 再加入含有黑胶虫清除剂的新鲜培养基, 2天一次,连续处理一周。

 

黑胶虫预防剂(1000×)abs9842

 

产品优势:

1)高效稳定:通过产品性能检测,能够有效防治细胞培养中的“黑胶虫”污染问题;

2)环保安全:对细胞无毒性作用,在细胞培养过程中不会对细胞造成影响,本产品为多肽类,不像抗生素会影响细胞生长状态并让细胞产生耐药性。

 

使用方法:

1)使用黑胶虫预防剂(1000X)时, 建议现配现用;

2)推荐黑胶虫预防剂(1000X)的稀释比例为1:1000, 例如:10mL的培养基加入10μL的黑胶虫预防剂(1000X)。

 

4、支原体污染

 

支原体是实验室中常见的污染细胞的原核生物,污染主要来自组织、血清等动物性原材料和操作者本身。支原体直径在0.1-0.3μm,显微镜下也很难分辨,一般通过吸取培养液上清采用qPCR技术扩增DNA检测。

 

1)检测原理

 

TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针,其5’末端携带荧光基团(报告基团),如FAM、CY5、VIC等,3’端携带淬灭基团,如TAMRA、BHQ1等。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一条特异性的荧光探针,探针完整时,荧光基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收。PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使荧光基团和淬灭基团分离,从而荧光监测系统(荧光定量PCR仪)可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成wan全同步。本试剂盒采用多重PCR的方法,用2种不同的荧光探针分别检测目标序列与内参。

 

2)清除试剂

 

支原体清除试剂Plus abs9253

 

产品优势:

● 特异性清除培养基中的支原体;

● 只需要3-6天,便可以有效清除支原体;

● 活性成分为抗生素,不会产生耐药性;

● 对细胞几乎无毒性,在100多种细胞上进行过验证,包括但不限于HEK293、Hela、MCF-7、MRC-5、NIH-3T3、CCC-ESF、CHO-S、CHO-K1、CHO-DG44、H295R、HL-60、K562、MDA-MB-231、SP2/0、T47D、BM和BV2等;

● 广谱性,可替代双抗,可以清除常见的革兰氏阴性和阳性菌;

● 可直接加入血清、培养基中,用于清除支原体污染。

 

3)使用方法

 

A、储存液的配制: 

称取适量支原体清除试剂,配制成10mg/mL的储存液。适当分装后-20℃保存。如长时间不使用,也可以-80℃保存;

 

B、预防支原体污染或抑制支原体:

在细胞培养液中加入适量支原体清除试剂储存液,使最终浓度为0.01-0.5μg/mL,通常推荐使用的浓度为0.2μg/mL或0.5μg/mL。在添加了前述剂量的支原体清除试剂的情况下,可以有效防止支原体污染或抑制支原体增殖;

 

C、清除污染的支原体:

对于发现或怀疑有支原体污染的细胞,在细胞培养液中加入适量支原体清除试剂储存液,使最终浓度为0.5-250μg/mL。推荐依次尝试使用25、50、100和250μg/mL这4个浓度。在添加了前述剂量的支原体去除试剂的细胞培养液中培养1周后,检测是否还存在支原体污染。如果还是存在支原体污染,可以酌情提高支原体清除试剂的工作浓度。

 

5、非污染情况

 

因为类器官原代培养中,会有很多杂质、组织碎片、成纤维细胞等,容易造成细胞“污染”的假象,其实并非污染,如下所示:

 

1)成纤维细胞

成纤维细胞的胞体细长,又呈纤维样,很容易被误认为是菌丝体,被误判成真菌污染。其实仔细观察,成纤维细胞成梭形,胞体中间粗,两头细长,而菌丝体整体粗细均匀

 

左图 基质胶底层贴壁生长的成纤维细胞

右图 真菌污染特征——霉菌

 

2)组织碎片

在提取原代细胞的过程中,在组织解离过程中产生很多细胞碎片及杂质,故原代培养背景会比较脏,这种情况也容易被误认为污染。接下来,小爱带大家了解一下组织碎片特点:

 

 

● 原代组织碎片往往成不规则形状,区别于菌团椭圆形菌落形态;

 

 

● 原代组织杂质往往大小不一,形态各异;菌团形态均一,均为椭圆状。

 

今天讲解就到这了,大家如有实验问题,欢迎一起交流哦!

  

本期小爱推荐


货号

品名

规格

货期

abs9841

黑胶虫清除剂PLUS(500×)

400uL×5

现货

abs9842

黑胶虫预防剂(1000×)

500uL×5

现货

abs9925

支原体检测试剂盒(qPCR法)

50T

1-2周

abs9253

支原体清除试剂Plus

20mg/100mg

1-2周

abs42020125

卡那霉素B硫酸盐

250mg

现货

abs42018967

硫酸庆大霉素溶液(10mg/mL)

10mL

现货

abs9244

青链双抗

100mL

现货

abs9246

青霉素-链霉素-两性霉素B三抗

100mL

现货

abs9245

青霉素-链霉素-庆大霉素三抗

100mL

现货

abs42013298

两性霉素B

1g/5g

现货

abs44071148

制霉菌素

1g/5g

现货




 

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