人参源性成分探针法荧光定量PCR试剂盒通用原则:

1, 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近于探针。

2, 扩增子的长度应不超过400bp,理想的*能在100-150bp内,扩增片断约短,有效的扩增反应就越容易获得。较短的扩增片断也容易保证分析的一致性

3, 保持GC含量在20%和80%之间,GC富含区容易产生非特异反应,从而会导致扩增效率的降低,及在SG分析中非特异信号。

4, 为了保证效率和重复性,应避免重复的核苷酸序列,尤其是G(不能有4个连续的G)

5, 将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。

b),探针设计指导

1,在设计引物之前设计探针

2,探针的Tm值应在68-70℃之间,如果是目测探针,则要仔细审查GC富含区。

3,探针的5’端要避免有鸟氨酸,5’G会有淬灭作用,即使被切割下来这种淬灭作用也还会存在

4,选择C多于G的链作探针,G的含量多于C会降低反应效率,这时就应选择配对的另一条链作为探针。

6, 探针应尽可能的短,不要超过30个bp。

7, 检测探针的DNA折叠和二级结构。

B16-F10, 小鼠黑色素瘤高转移细胞

SGC-7901, 人胃腺癌细胞系

SK-N-SH, 人神经母细胞瘤细胞

SK-MEL-1, 人皮肤黑色素瘤细胞

A549, 人肺癌细胞系

SKOV3/Taxol-25, 人卵巢癌紫杉醇耐药细胞株

A-375 [A375], 人恶性黑素瘤细胞株

A549/DDP, 人肺腺癌耐药细胞株

SP2/0, 小鼠骨髓瘤细胞

WM35, 人黑色素瘤细胞

BxPC-3, 人原位胰腺腺癌细胞株

U-2 OS, 人骨肉瘤细胞

WM451, 人黑色素瘤细胞

SW 1990 [SW-1990, SW1990] , 人胰腺癌细胞

C6, 大鼠脑胶质瘤细胞

UM-UC-3, 人膀胱移行细胞癌

Hela, 人宫颈癌细胞系

HNE2, 人鼻咽癌细胞系

SKOV3 [SK-OV-3], 人卵巢癌腺癌细胞系

786-O [786-0], 人肾透明腺癌细胞

HEC-1A, 人子宫内膜癌细胞系

Caki-1, 人肾透明细胞癌皮肤转移细胞

Ishikawa, 人子宫内膜癌细胞系

ACHN, 人肾细胞腺癌细胞

JEC, 人子宫内膜腺癌细胞系

BPH-1, 人前列腺增生细胞

RL95-2, 人子宫内膜腺癌细胞系

Ca Ski, 人宫颈癌细胞

MCF-7 [MCF7], 人乳腺癌细胞系

Raw264.7, 小鼠单核巨噬细胞白血病细胞