在土壤碳通量测量中，是否需要同时测量甲烷取决于研究目的和具体的测量方法。土壤碳通量通常指的是土壤与大气之间的二氧化碳（CO₂）交换速率，而甲烷（CH₄）是另一种重要的温室气体，其产生和排放与土壤微生物活动密切相关。在某些情况下，研究者可能会同时测量CO₂和CH₄的通量，因为这两种气体的交换过程可能受到相似的环境因素影响，如温度、湿度和土壤类型。

然而，并不是所有的土壤碳通量测量都需要同时考虑甲烷。例如，如果研究重点是评估土壤的CO₂排放，那么可能只需要专注于CO₂的测量，而不需要测量甲烷。此外，甲烷的测量通常需要特殊的设备和技术，因为甲烷的浓度相对较低，而且容易受到其他气体的干扰。

在实际应用中，有些设备可以同时测量CO₂和CH₄的通量，如FG-809土壤碳通量测量系统，它可以用于土壤碳通量测量，并能提供关于甲烷通量的信息，同时还可以提供氧气浓度、相对湿度、大气压力、PAR等环境信息和土壤温湿度电导率等土壤测量信息。另一方面，一些设备可能专门设计用于测量CO₂通量，而不包含甲烷测量功能如FS-3080E。

总之，是否需要同时测量甲烷取决于研究的具体需求和试验设计。在某些情况下，同时测量CO2和CH4可以提供更全面的土壤碳循环信息，但在其他情况下，单独测量CO₂可能就足够了。