倒置显微镜组成和普通显微镜一样，只不过物镜与照明系统颠倒，前者在载物台之下，后者在载物台之上，用于观察培养的活细胞，具有相差物镜。倒置显微镜主要是利用光学平面成像的方法，和放大镜起着同样的作用，就是把近处的微小物体成一放大的像，以供人眼观察。其光路长，光损较大，光路设计较复杂，对样品高低无要求，检测方便快速，不适合多视场分析。一般用于观察培养皿或者培养瓶中的组织培养、细胞离体培养、浮游生物、环境保护、食品检验及流质沉淀物的观察。

    而正置显微镜在观察时成像为正像，这种观察方式符合广大用户的观察方式，光路设计简单，光损少，样品高度有要求，方便多视场观察，镜头不易落灰易维护，适合观察切片，适用于研究单位。