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荧光及可视化 RT-LAMP 扩增试剂盒简介

时间:2022-08-02      阅读:1074

产品及特点

本产品是根据本公司的双染料 RT-LAMP 技术开发的荧光和可见光双模式检 试剂盒 ,它既可以用于荧光 RT-LAMP 扩增及检测 ,也可以用于可视化 RT-LAMP 扩增及检 ,适用于各种针对核酸的快速定性检测。  本产品具有下列特点:

1.   含可光和荧光染料,  既可以用金属浴和水浴扩增用可见光肉眼判断结果 ,也可

用荧光 PCR 仪进行实时荧光检测。

2.   内含的 dUTP-UNG 可防交叉污染

3.   特异性比 RT-PCR 高,  因为 RT-LAMP 扩增使用 4-6 条引物而不是两条。

4.   灵敏性可达 10 拷贝/反应以下  (随引物而不同)  ,故假阴性率更低。

5.   只可用于科研 ,只可进行定性检测 ,不能用于定量检测

规格及成分

 

   

编号

塑料盒包装

 

MMLV 逆转录酶(含 RI),  200UL

60905a

50 μL  (黄盖)

4 ×RT Buffer  (含 dNTP)

60905b

250 μL  (白盖)

5 ×荧光及可视化 LAMP MagicMix

200603a

200 μL  (绿盖)

Bst DNA 聚合酶 2.0  ( 8U/uL)

200403

50 uL (红盖)

RT-LAMP 阳性对照模板-引物混合物

130923a

20 μL  (黄盖)

纯水

100935

1mL  (亮黄盖)

使用手册

200603sc

1 

运输及保存

低温输,  -20 ℃保存,保存期限为一年。

备试剂

RT-LAMP 模板及 RT-LAMP 引物、PCR 级石蜡油  (仅对使用金属浴或水浴者)  。

使用方

准备工作:如果使用水浴锅或金属浴,  需要在实验启动前打开并调到 60-65℃。如果 用金属浴,还必须在孔中加水以填充金属孔和反应管间的空隙。金属浴和水浴温控远 远不如 PCR 仪器,  所以使用前需要用阳性对照和阴性对照  (水)  做预实验确认可用。

  样品 RNA 的制备

1.  用自选方法纯化样品的 RNA,本试剂盒跟市场上大多数 RNA 提取试剂盒兼容。

2.  如果有 N 个样品,  则至少需要做 N+2 个样品制备,  包括一个制备阳性对照(制备

时加入自备的跟要测的靶分子相同的阳性对照模板, 一起经历提取过程) 和一个 阴性对照  (用水替代样品)。最后 N+2 个样品一起进行 RNA 提取操作,得

N+2 个 RNA 样品。

二、  合成 1st-strand cDNA

3.  按下表配制 RT 反应体系:

 

加入

 

 


   

RNA 模板

 RNA

poly(A) mRNA

或专一的 RNA

注意 RNA 样品不能有基因组 DNA 污染。

 

 

100-500 ng

10-500 ng

0.01pg-500ng

 

自备引物 F3

1 μL

4 ×RT Buffer  (含 dNTP)

5 μL

RNase-free 

补水到  19 μL

4.  70℃保温 5 分钟后立即冰浴。

5.  37℃保 5 分钟。对富含二级结构的高 GC RNA 模板,可改成 45℃保温 5 分钟。

6.  加入 1 μL (=200 U) MMLV 逆转录酶(含 RI)  ,终体积为 20μL

7.  42℃保温 60 分钟。

8.  70℃保温  10 分钟以终止反应,放置在冰上待用。合成的 cDNA 可以直接作为

LAMP 模板使用,不需要纯化。

三、   荧光及可视化 LAMP 扩增及检测  ( 20μL 体系)

9.  应设置:如果有 N+2 个 cDNA 样品,则最好设置 N+4 个 LAMP 扩增,增加 LAMP

阴性对照和 LAMP 阳性对照各 1 个。在 N+4 个 0.2mL PCR 管中加入下列成分:

 

N+2 

样品管

LAMP  性对照

LAMP

性对照

5 × 荧 光 及 可 视 化 LAMP MagicMix

4 μL

4 μL

4 μL

20×引物混合液

 1 μL

1 μL

-

N+2 个样品cDNA

最多 14 μL

-

-

RT-LAMP 阳性对照 模板-引物混合物

 

-

 

-

15 μL

Bst DNA 合酶 2.0

 1 μL

1 μL

 1 μL

纯水

 

14 μL

-

 

10. 混匀后进行扩增。由于本产品含双染料, 可以根据实验室条件选择下列三种方式进 扩增和检测。

11. 如果使用 PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,肉眼检测,则必须先在每个反应管中  30 μL 自备的石蜡油,否则保温期间反应体系的水分会蒸发,影响反应效率(如 果使用 PCR 仪器并开启热盖,则可以不加石蜡油)。  60-65℃保 90 分钟,肉 眼观察管内液体颜色。

12. 如果使用荧光定量 PCR 仪:  设为 60-65℃保温 1 分钟/循环,   90 个循环,  每分

 


 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

钟在 FAM 通道采集一次荧光信号。

13. 如使用 PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,再使用 qPCR 仪进行终点法荧光读数: 则在扩增前和扩增后,分别在 qPCR 仪器上测荧光读数(温度设为 60-65 ℃,  1 循环,每次循环 1 分钟,在 FAM 通道采集一次荧光信号。注意:  测荧光读数必 须在 65℃进行)  。扩增反应按 60-65 ℃ ,90 分钟进行

   结果分析及解读

14. 如果是用普通 PCR 仪器、水浴或金属浴进行的扩增,反应结束后只能肉眼判断结 果。将反应管放置白色背景(如白纸) 前观察。扩增阳性对照管内反应液将呈现 蓝色,无模板和无引物的阴性对照将呈浅蓝色。如果扩增阳性对照管内反应液不呈 现蓝,或无模板和无引物的阴性对照任何一个呈现蓝色,则说明试剂有问题,  验无效。请跟厂家联系。

15. 如果实有效,  则分析 N+2 个样品管的结果。如果样品管反应液的颜色接近扩增 阳性对管则说明有扩增,如果接近无模板和无引物的阴性对照,  则说明无扩增。 反应结果示例见左图(9 为阴性,  10 为阳性)  。

16. 如果用荧光 PCR 仪进行扩增, 则可分析扩增曲线和 Ct。试剂盒提供的阳性对照  Ct 将小于 60,如果大于 60,说明试剂可能失效,  需跟厂家联系。无模板阴性 对照和无引物阴性对照的 Ct 将大于 90。如果任何小于 90,则说明试剂或环境被 污染,需重复实验或跟厂家联系。如果阳性对照和阴性对照 Ct 都在正常范围,则 分析样品的 Ct。Ct 小于 60 的判断为阳性,大于 90 判为阴性,  在 60-90 之间则 需要重复检测。

17. 如果使用 PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,肉眼检测,再使用荧光定量 PCR  终点法荧光读数来判断阴阳性, 则先比较阳性对照和阴性对照。阳性对照样品 增后信号增幅应该超过 100%,  阴性对照扩增后信号增幅应该低于 50%,否则 无效, 请与厂家联系。如果两个对照均有效,则比较样品扩增前后荧光读数的 差值。如果扩增后荧光信号增幅低于 50%,则判断为阴性。如果荧光信号增幅高 100%,则判断为阳性。荧光信号增幅在 50- 100%之间的,  则需要重测

18. 当实时荧光检测和可视化检测同时用于判读结果时,如果彼此不一致, 以实时荧光 LAMP 的数据为准。一般可视化结果滞后实时荧光检测结果 20-30 分钟,也就是 说,在 qPCR 仪上第 30 分钟时呈现阳性的样品,  其反应液的颜色变化一般在第

50-60 分钟时才能观察到。

联产品

酸纯化病毒保存液,  PCR 级石蜡油

 

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