氢气发生器由电解池、纯水箱、氢/水分离器、收集器、干燥器、传感器、压力调节阀、开关电源等部件组成。只电解纯水即可产氢。通电后，电解池阴极产氢气，阳极产氧气，氢气进入氢/水分离器。氧气排入大气。氢/水分离器将氢气和水分离。氢气进入干燥器除湿后，经稳压阀、调节阀调整到额定压力（0.02～0.45Mpa可调）由出口输出。电解池的产氢压力由传感器控制在0.45Mpa左右，当压力达到设定值时，电解池电源供应切断；压力下降，低于设定值时电源恢复供电。  

氢气发生器允许用户根据用气需求来灵活地增加模块，增加氢气输出，能够按需提供氢气，纯度达95%至99.999%，视不同的型号而异。实现了模块化设计，可通过增加模块来提升氢气产量，以应对用气需求的增长。  

仪器智能化预警保护系统，确保用氢安全，具有低水位报警、缺水自动停止产氢、氢气超压停止产氢、泄放保护等功能，高纯氢气发生器是从航天燃料电池技术中开发的新型产品，其工作原理是通过电解水产生氢气，产生的氧气则放空进入大气。每生成1mol氢气，生成的氢气经冷凝、干燥后进入金属氢化物储氢罐，供氢利用某些合金或金属与氢气的可逆反应来实现。  

仪器只有在需要的时候才产生氢气，因为其在特定的时间内只产生量的气体，因而可以通过压力来监控系统是否过载。在系统过载的情况下，氢气发生器会自动关闭，因而不可能在色谱系统内形成爆炸混合物。当系统发生泄漏，流速高于发生器大效率时，系统也将自动关闭，以避免发生危险。